在结核病中发现新的抗生素耐药基因

一项对来自23个国家的1万多种不同结核分枝杆菌分离物的大规模分析揭示了与13种一线和二线新型和重新利用的抗生素耐药性相关的新基因。8月11日发表的两篇新论文描述了由结核病综合耐药性预测:一个国际联盟(CRyPTIC)开展的这项工作^th在开放获取的期刊中公共科学图书馆生物学．

结核病是一种可以治愈和预防的疾病;85%的患者可以通过六个月的药物治疗成功治愈。尽管如此，结核病导致的死亡人数比其他疾病要多传染病耐药结核病是一个持续的威胁。更好地理解M。肺结核赋予的变异抗生素耐药性对更好的监测都很重要耐药菌株以及新药的开发。

在第一篇新论文中，研究人员概述了他们如何收集了12289株结核分枝杆菌分离物的开放获取数据纲要，这些数据纲要由CRyPTIC在世界各地的合作实验室处理。对每个分离物进行测序，然后在高通量网格上使用不同浓度的13种抗微生物药物进行测试。在该手册中包含的样本中，6814个对至少一种药物具有耐药性，其中4685个样本对多种药物或一线治疗利福平具有耐药性。

在第二篇论文中，该联盟介绍了他们从一项全基因组关联研究(GWAS)中获得的发现，该研究使用了10228株结核分枝杆菌的数据。对于所有13种药物，该小组发现了与最低抑制浓度显著增加相关的未分类变体，最低抑制浓度是阻止结核分枝杆菌生长的抗生素的最低浓度。分析这种浓度，而不是二元耐药或不耐药的结果，允许识别仅引起抗生素反应的细微变化的变异，这些变化可能通过增加药物剂量来克服。研究人员选择了对每种药物产生耐药性的20个最重要的基因，并更深入地描述了这些特定基因的效应大小和变异。

作者指出:“我们的研究表明，全球伙伴关系能够大大提高我们对与结核分枝杆菌耐药性相关的遗传变异的认识。”

合在一起，这些文件不仅揭开了真相特定的基因可以对其进行跟踪，以更好地了解结核分枝杆菌的耐药性情况，同时也为未来的病原体研究提供了框架。

“该纲要不是为测量患病率或估计耐药预测工具的‘现实世界’错误率而设计的;相反，它可以作为一种资源，通过丰富[的突变目录，加速抗菌素耐药性诊断的发展。全基因组测序耐药性预测，提高我们对耐药性遗传机制的理解，并确定重要的诊断差距和耐药性模式，”作者说。“数据概要是完全开源的，希望它将促进和激发未来几年的研究。”

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