导致肾癌的基因改变有多常见

导致肾癌的基因改变有多常见
肾系因子PAX8与ccRCC致癌因子HIF2A之间的染色质水平相互作用a,b, ccRCC细胞系(a)和非ccRCC细胞系(b)的CRISPR-Cas9功能丧失筛选结果汇总。敏感性评分,日志2在试验结束时,与试验开始时相比,每个基因的前三个耗尽sgRNAs(每个条件重复两次)的平均值。ccRCC依赖项显示为红色。CTRL,非目标控制的平均值。c, TCGA数据中癌症类型特异性ATAC-seq峰值与ccRCC细胞中PAX8和HNF1B耗尽后可达性降低的峰值之间的重叠。上轴,重叠比值比(黑色),95%置信区间。下轴,P值,单边费雪精确检验(红色)。d,通过RIME检测786-M1A细胞中PAX8-和hif2a相互作用蛋白的重叠。e,来自HIF2A和PAX8相互作用体的89个共享核蛋白之间物理连接的网络呈现。蛋白质名称在扩展数据图4a中提供。f,来自786-M1A和OS-LM1异种移植物(各3个肿瘤)的HIF2A和PAX8 ChIP-seq信号的热图,这些区域具有强烈的PAX8 - HIF2A共结合(红色)、主要的HIF2A结合(蓝色)和主要的PAX8结合(灰色)。 Top panels show the average signal within each of the three categories in the same colors. g, HIF2A and PAX8 co-bound genomic regions with reduced accessibility following PAX8 depletion. Median ATAC-seq signal from 786-M1A cells expressing a control RNAi construct (shRen, N = 6) or PAX8-targeting RNAi constructs (shPAX8, N = 6). Median HIF2A and PAX8 ChIP-seq signals from 786-M1A and OS-LM1 xenografts, three tumous each. Asterisk indicates a region of interest. h, Fraction of PAX8 peaks (red) in all high-confidence open chromatin regions (all) and HIF2A ChIP-seq peaks in 786-M1A and OS-LM1 xenograft tumors. Asterisk indicates P < 1.0 × 10−300,双侧Fisher精确检验。信贷:自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 04809 - 8

一个国际研究小组调查了为什么通常与肾癌相关的突变会导致肾癌,而不是其他类型的癌症。

通常,癌症中发生的基因突变只与某些癌症亚型有关。造成这种情况的原因在很大程度上仍不清楚。

根据发表在自然,与突变相关的能力推动癌症发病的是一种被称为转录因子的蛋白质,它调节健康肾细胞的正常功能。

“这项研究的重点是肾癌,但同样的原理可能适用于更普遍的癌症。癌症通常是,需要新的治疗方法。我们在实验模型中确定了抑制肾癌生长的因素。这些分子是潜在的药物靶点,”赫尔辛基大学该项目的首席研究员Sakari Vanharanta说。

一种常见的基因突变会增加患肾癌的风险

研究中检验的机制与透明细胞有关这是肾癌最常见的亚型。大多数欧洲人携带一种基因变异,增加了患这种疾病的风险。

在这项研究中,实验癌症生物学方法与靶向患者标本分析相结合。研究人员测试了控制正常肾细胞组织特异性功能的转录因子是否也需要肾癌的生长。

结果表明,与肾癌相关的突变促进肿瘤形成的能力依赖于在正常肾细胞中特别活跃的转录因子。肾系特异性实验灭活后,癌症突变不再能够激活与肿瘤生长相关的基因。

“基因改变或突变在致癌中的作用已经得到了很好的证实,但我们通常不知道癌症突变是如何导致癌症的。这使得在癌症治疗中利用遗传信息变得困难。了解癌症相关的功能后果因此很重要,而且在某些情况下,它可以帮助科学家开发新的抗癌药物,”Vanharanta说。


进一步探索

研究人员在透明细胞肾细胞癌中鉴定剪接变异生物标志物

更多信息:Saroor A. Patel等人,肾谱系因子PAX8控制肾癌的致癌信号,自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 04809 - 8
期刊信息: 自然

所提供的赫尔辛基大学
引用:常见的基因改变如何导致肾癌(2022,8月9日)检索到2022年9月12日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-08-common-genetic-kidney-cancer.html
这份文件受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的公平交易外,未经书面许可,不得转载任何部分。内容仅供参考之用。
85股票

对编辑的反馈