免疫细胞在终生防御感染中获得基因组疤痕

免疫细胞在终生防御感染中获得基因组疤痕
与恶性肿瘤的突变模式的比较。A,B,SNV(A)和结构变化(SV)负担(B)通过正常细胞类型或恶性肿瘤。盒子显示了四分位间范围,中心线显示中位数。晶须延伸至最小范围或1.5×四分位间范围。正常淋巴细胞(洋红色)排除小儿样品。AML,急性髓样白血病;CLL,慢性淋巴细胞性白血病;剪切,皮肤;DLBC,扩散的大B细胞。C,每个基因组突变特征的比例。 For each genome, signatures with a 90% confidence interval lower bound of less than 1% are excluded. Normal lymphocytes (labeled in magenta) are from donor AX001. Treg, T regulatory cells. d,e, SBS9 burden (d) and proportion (e) by cell type or malignancy. The box shows the interquartile range and the center line shows the median. Whiskers extend to the minimum of either the range or 1.5× the interquartile range. f,g, Heat map showing the level of enrichment of SBS9 (f) and SHM (g) signatures near frequently mutated genes for that signature compared with the whole genome. Number of structural variants per group: B cell: 145, T cell: 841, ALL: 523, Burkitt lymphoma: 305, CLL mutated: 252, CLL unmutated: 440, cutaneous T cell lymphoma: 204, DLBC lymphoma: 3,754, follicular lymphoma: 1,095. a,b,d,e, Number of genomes per group: naive B: 68, memory B: 68, naive T: 332, memory T: 87, Burkitt lymphoma: 17, CLL mutated: 38, CLL unmutated: 45, cutaneous T cell lymphoma: 5, DLBC lymphoma: 47, follicular lymphoma: 36, multiple myeloma: 30, myeloid–AML: 10. Credit:自然(2022)。doi:10.1038/s41586-022-05072-7

被称为淋巴细胞的免疫细胞已经比以往任何时候都更详细地进行了遗传测序,以研究这些细胞中的突变如何影响衰老过程。

免疫已经在遗传上比以往任何时候都进行了遗传测序,从而深入了解它们如何以及何时积累突变,例如与某些癌症发展相关的突变。

在这项研究中,约克大学的惠康桑格研究所的研究人员约克生物医学研究所,合作者创建了一项新协议,使他们能够从A中成长和顺序从A中生长和顺序。bob88体育平台登录,该技术也可以用于其他研究领域。

于2022年8月10日出版自然该研究发现,在健康的B细胞中看到的突变与在癌症B细胞中看到的突变基本相似,这表明癌症的发展是由相同的突变过程引起的。更多地了解导致这些突变在某些细胞中发展成癌症而不是其他细胞的因素可以帮助阐明这种疾病的起源。

这些免疫细胞中的突变(称为淋巴细胞)也可能影响免疫系统的衰老和其他疾病,并进一步了解这些因素在一个人的寿命上发生的何时以及如何发生,这增加了我们对衰老过程中发生的事情的了解。

免疫细胞称为淋巴细胞是自适应免疫系统的一部分,包括记忆B细胞和记忆T细胞,两者都经历了一定量的遗传突变,以便能够识别和抵抗病原体。

在这项新研究中,科学家发现,尽管这种正常的遗传突变主要针对抗体的基因,但基因组中其他地方发生了令人惊讶的附带损害。正是这种脱靶突变会导致淋巴细胞癌变并发展成为一种称为淋巴瘤的癌症。

除此之外,他们发现,随着淋巴细胞通过体内传播到感染的调查,它们会暴露于其他DNA损伤剂,这可以进一步增加突变的数量。

该团队对700多个供体的700多个正常免疫细胞的基因组测序,年龄从0到81岁。他们发现,B细胞和T细胞中突变的数量和模式因细胞而异。这种变化的某些变化是由于随着年龄的增长而积累的突变引起的,而其他变异是由于抗体的正常遗传增强对基因组的脱靶损害引起的。加上某些变化是由于阳光受到的DNA损伤引起的,因为淋巴细胞通过皮肤测量以引起感染。

该小组发现,健康免疫细胞中的某些突变与淋巴瘤中已经鉴定出的突变相同,这表明淋巴瘤来自正常情况下相同的基础突变过程

与人与人之间的变异相比,细胞对细胞的变化要大得多,这表明,在一个人的一生中,身体不同区域内的变化(例如某些感染和炎症)更可能引起与癌症和疾病有关的突变。基因突变。

这项研究提供了对健康淋巴细胞的突变景观以及引起这些突变的过程的更深入的见解,这增加了当前对衰老的理解。需要在组织之间进行进一步研究这些突变和过程有所不同,以调查这些突变和过程是否为将来的治疗提供了任何途径。

“随着年龄的增长,适应性免疫系统发生了很大变化,但是以前不可能以与我们在这里实现的相同细节进行研究。我们的研究是了解淋巴细胞中如何随着时间和时间积累的又一步一步这些影响对衰老过程的影响。我们为扩展细胞而制定的协议也可以应用于其他研究领域,我们希望它对其他科学家对我们来说都是有价值的。”Heather Machado,Wellcome Sanger Institute的第一作者。

“我们的研究表明,即使在整个身体中发挥相同的作用,他们获得的突变与其特定的组织环境有关。这些环境在某些淋巴瘤的发展中可能发挥更大的作用。更详细地了解这些过程可能能够阐明为什么其中一些细胞继续发展为癌症,而另一些细胞则没有。”bob88体育平台登录约克大学。

“我们的研究开始填补有关如何如何在自适应免疫系统中,进食衰老。通过对大约700个淋巴细胞基因组进行测序,我们已经开始更好地了解随着时间的流逝而发生的突变过程,以及它们与淋巴瘤的发展如何相关。尽管需要更多的研究,但这项研究为进一步研究这一领域奠定了坚实的基础。


进一步探索

仅仅因年龄相关疾病而不应归咎于较高的突变率

更多信息:Heather E. Machado等人,人类淋巴细胞中的多种突变景观,自然(2022)。doi:10.1038/s41586-022-05072-7
期刊信息: 自然

引用:免疫细胞在终生防御感染中获得基因组疤痕(2022年8月11日),2022年8月26日从//www.pyrotek-europe.com/news/news/2022-08-mmmune-cells-cells-cells-genomic-scars-scars-scars-lifetime.html
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