分子图谱揭示了慢性淋巴细胞白血病的遗传驱动因素
慢性淋巴细胞白血病(CLL)是一种血液和骨髓癌症,存在于不同的形式,产生于不同的原因,一种新构建的遗传变化景观图,提供了对这种复杂恶性肿瘤的更好理解,可以为患者带来更准确的预后,改进诊断和新的治疗方法。这项工作发表在自然遗传学这项研究是由来自麻省总医院癌症中心、丹娜-法伯癌症研究所、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的国际研究人员合作进行的。
CLL以缓慢或快速增长的形式存在癌症并与某些基因突变,但它还没有完全的特征。以前的分析只提供了CLL“地图”的片段,每一个都专注于特定类型的患者或有限的数据。为了更深入地了解CLL及其生物学基础分子亚型在美国,科学家们开始利用迄今为止最大的CLL数据集构建地图。
为了构建CLL图谱,研究小组分析了基因序列的变异,基因表达模式以及对1148名患者的dna(或基因组、转录组和表观基因组数据)进行化学修饰。丹娜-法伯癌症研究所干细胞移植和细胞疗法部门主任、哈佛医学院医学教授、共同资深和共同通讯作者凯瑟琳·吴医学博士说:“这样的CLL地图最终可以在临床中得到利用,其中新患者的基因组特征可以与具有相似基因谱的患者的治疗和结果进行比较。”“这种分析可能有助于根据新患者的特定分子特征更准确地调整预后和治疗,从而更接近精准医疗。”
科学家们确定了202个基因(其中109个是新基因),当突变时可能会导致CLL,他们改进了CLL亚型的特征,具有独特的基因组特征和预后。除了基因序列,某些基因的表达模式进一步细分CLL,并提供有价值的预后信息。“我们的研究揭示了CLL的遗传和生物景观比以前认识到的要复杂得多,”共同资深和共同通讯作者Gad Getz博士说,他是马萨诸塞州综合癌症中心生物信息学主任和Broad研究所癌症基因组计算分析组主任。
患者的临床结果与基因组、转录组和表观基因组特征的组合相关,因此整合这些数据可以预测患者经历缓解与发展为更晚期癌症的可能性。
“我们正在发布一个基于CLL地图的CLL地图'门户',它将是一个互动网站用于转化研究人员作为进一步研究的资源,例如了解更多关于CLL的不同驱动因素和亚型,”Getz说。
这项研究也由来自西班牙的José I. Martín-Subero (IDIBAPS)、Xose S. Puente(奥维耶多大学)和Elias Campo (IDIBAPS和巴塞罗那医院诊所)领导;以及来自德国乌尔姆大学的Stephan Stilgenbauer。
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