研究人员发现了一种风险较低的方法来监测乳腺癌的进展
![Schematic for identifying subset of binding sites with TF footprints. (A) When TFs or nucleosomes are bound at TFBSs, they protect different lengths of DNA from nucleases in dying cells in the human body. (B) When sequenced cfDNA fragments are mapped to TFBSs ± 50 bp, varying numbers of short and long cfDNA fragments are found at the three TFBSs shown in (A). (C) cfDNA fragment length distribution is estimated at each TFBS (purple bars) and smoothed using kernel density estimation (kde) (green line). (D) K-means clustering is performed on smoothed length distribution to group TFBSs with similar cfDNA fragment length distribution. Here, smoothened length distributions of clusters of CTCF TFBS are shown. Weighted length (W.L.) for each CTCF length cluster is shown in parentheses. A.U., arbitrary units. Credit: <i>Science Advances</i> DOI: 10.1126/sciadv.abm4358 研究人员发现了一种风险较低的方法来监测乳腺癌的进展](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2022/researchers-find-less.jpg)
科罗拉多大学安舒茨医学院的研究人员发现了如何通过分析血浆来提取乳腺癌肿瘤和疾病进展的关键信息,而不是使用更具侵入性的组织活检。
“这只是一次抽血,”该研究的高级合著者Peter Kabos说,他是科罗拉多大学医学院肿瘤内科的医学副教授,也是科罗拉多大学癌症中心的成员。“这使我们能够透过表面看到这种疾病的决定性特征。优点是我们不需要做重复的组织活检。”
这项研究发表在今天的杂志上科学的进步.
研究人员和临床医生分析血浆以确定基因突变癌症.在血浆中发现的DNA包含更多的信息。
“我们只需要知道从哪里寻找,”卡波斯说。
研究发现,血浆细胞游离DNA (cfDNA)含有高分辨率,全基因组结合雌激素受体(ER)和FOXA1谱乳腺癌.FOXA1是一个与乳腺癌相关的基因。
“我们可以直接从血液中获得从组织活检中获得的相同分子信息,”该研究的另一位资深合著者Srinivas Ramachandran博士说,他是生物化学和生物化学的助理教授分子遗传学在哥伦比亚大学医学院“如果我们可以在不做活检的情况下提取这类信息,我们就可以为治疗决策提供更多的信息。”
死亡的细胞人体研究人员说,将它们的内容物释放到血液中。当癌症出现时,它也会向血浆中释放cfDNA片段。
Ramachandran说:“这表明cfDNA有潜力实时绘制肿瘤表观基因组,因此可以帮助从血浆中发现癌症的调控格局。”
根据这项研究,这些发现可能会导致定义疾病状态、预测治疗结果以及可能选择最有效的癌症治疗的全基因组地图。由于获取肿瘤组织的风险,这些现在都不现实。
卡波斯和拉马钱德兰写道:“在我们的研究中,我们利用了一种替代方法来获取相同的信息……以一种最低侵入性的方式来定义潜在的疾病生物学。”
两人都表示,从癌症DNA中收集的信息可以用于未来开发新的疗法。他们说,用于乳腺癌的血浆分析可能也适用于其他恶性肿瘤。
“鉴于大多数肿瘤释放cfDNA,我们相信我们使用cfDNA转录因子脚印对ER+乳腺肿瘤的表征代表了表征肿瘤表型的冰山一角等离子体而且适用于所有疾病状态,”加州大学癌症中心成员拉马钱德兰说。
进一步探索