“RNA钓鱼”揭示了黑色素瘤恶性肿瘤和转移的新司机

“RNA钓鱼”揭示了黑色素瘤恶性肿瘤和转移的新司机
黑色素瘤RBPome的表征。(一)RNA的示意图表示interactome捕获(RIC)过程。通过免疫印迹(B) RBP浓缩评估。(C)的总数量和重大(BFDR≤0.05)蛋白在里克洗出液中恢复过来。最重要的蛋白质也恢复与BFDR≤0.01(虚线)。意义是计算使用SAINTexpress通过比较非交联型条件。专用交联与显著RBPs两个细胞系的重叠显示在右边。(D)比较的黑色素瘤RBPome(不包括组蛋白和核糖体蛋白)与之前RBPomes出版。(E)分析RNA绑定域(rbd)出现在黑素瘤RBPome。域词云表明蛋白质的频率域的数据集。 Credit:核酸的研究(2022)。DOI: 10.1093 / nar / gkac605

研究基因调控中心(点)已经确定了几个蛋白质参与黑色素瘤的发展,最致命的皮肤癌。的proteins-PDIA6-was发现特别重要的恶性肿瘤。老鼠实验表明,黑色素瘤细胞水平降低的PDIA6已经转移到肺的能力受损。

研究者发现PDIA6促进黑色素瘤恶性肿瘤通过绑定RNA分子在肿瘤的细胞。该研究的作者,发表在《华尔街日报》核酸的研究“La Caixa”基金会的支持下确定该地区表面PDIA6 RNA分子结合。通过进一步的研究,这些信息可以帮助设计新的治疗性化合物,防止黑色素瘤的传播从一个身体的一部分到另一个地方。

PDIA6之前与淋巴瘤的发展,乳腺癌和。如果进一步的研究发现,PDIA6也在这些其他RNA结合,它可能导致相同的治疗策略,目标在不同的肿瘤的作用机制。

这一发现可能是由于一个“RNA钓鱼”技术专门设计用于识别RNA结合蛋白。这些类的蛋白质进行各种各样的生物功能,在癌症,赋予弹性细胞,帮助他们适应不断变化的环境和快速应对外部威胁,促进癌症恶性肿瘤和抵抗治疗。

这项技术,也被称为RNA interactome捕获、涉及钓鱼所有信使RNA在细胞。研究人员然后看到哪些蛋白质附着在他们,通知rna结合水平和多样性的活动发生在细胞。

“伟大的rna结合蛋白治疗的兴趣。这项技术在这项研究可以帮助我们测量他们的活动,一些不可能在全球范围内与传统方法。使用时比较肿瘤和肿瘤细胞,这种方法可以帮助我们识别蛋白质可能在癌症的发展过程中扮演着重要角色,并进行进一步的实验告诉我们,它们是如何工作的。我们使用这个蓝图在黑色素瘤发现新的漏洞,我们希望这可以重复寻找新的治疗靶点在其他类型的癌症,”Fatima Gebauer博士解释道,中国中铁研究员和该研究的资深作者。

数以百计的rna结合蛋白的识别技术,研究人员选择24进行进一步分析使用不同的标准,例如因为他们的rna结合活动没有被描述或之前他们没有与癌症的发展。研究人员将PDIA6进一步描述其功能,包括移植小鼠模型实验。未来的研究可以深入研究其他23个蛋白质的角色。

“我们只是抓表面的rna结合蛋白的潜在治疗靶点。通过功能方法识别rna结合活动,紧随其后的是详细的分子认识的能力,将为抑制剂的设计可以大大提高个性化治疗Gebauer博士总结道,“。


进一步探索

探索如何Staufen和Argonaute蛋白质相互作用

更多信息:该处Mestre-Farras et al,黑色素瘤RBPome识别揭示PDIA6作为一种非传统的rna结合蛋白参与转移,核酸的研究(2022)。DOI: 10.1093 / nar / gkac605
期刊信息: 核酸的研究

由基因调控中心提供
引用:“RNA钓鱼”揭示了黑色素瘤恶性肿瘤和转移的新司机(2022年8月3日)检索2022年9月15日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-08-rna-fishing-reveals-driver-melanoma.html
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