2022年9月8日

研究表明，所有COVID-19感染都包括SARS-CoV-2病毒变体的广泛混合

通过凯斯西储大学

凯斯西储大学的研究人员表示，所有COVID-19感染都包括SARS-CoV-2病毒变体的广泛混合
对2020年4月至2021年8月期间感染个体的140个COVID样本的全基因组测序显示，感染特征与不同颜色分区所代表的主要毒株一致。每个水平线表示一个已排序的样本，而沿袭的特定位置则垂直显示。灰色阴影框表示在我们的样本中观察到的混合等位基因频率。有趣的是，我们观察到在B.1.1.7和B.1.617.2(紫色分区)之间的转换过程中代表混合等位基因频率的样本。论文:COVID-19感染和传播包括复杂的序列多样性，PLOS Genetics, 2022年9月8日。资料来源:Ernest (Ricky) Chan

凯斯西储大学的研究人员在360名对病毒感染进行基因测序的患者中发现，SARS-CoV-2病毒存在广泛的遗传变异，这表明所有个体感染都包括病毒的多种变体。

研究人员指出，关于通常强调单一的优势毒株，导致漏报病毒并可能对公共卫生规划和应对造成严重后果。

“我们的工作让人们注意到传染病的复杂性，当只考虑一个世界中数量最多的病毒时，这种复杂性往往被过度简化了凯斯西储医学院克利夫兰计算生物学研究所生物信息学核心主任Ernest (Ricky) Chan说:“我们证明了检查历史上被认为是噪音的变化的重要性。”“我们发现，在SARS-CoV-2感染中低频率观察到的遗传变异可能是导致后期传播激增的新毒株的早期指标。”

这篇题为“COVID-19感染和传播包括复杂的序列多样性”的论文将于2022年9月8日在美国《科学》杂志上发表公共科学图书馆遗传学．

CWRU团队对来自俄亥俄州东北部250名患者的SARS-CoV-2病毒进行了全基因组测序，并使用了来自另外110名患者的类似数据，这些患者由国际研究合作者提供感染病毒的全基因序列。

这些数据是在COVID-19大流行的早期开发的，当时是Alpha变种，然后是Delta变种是主要的关注点。这项工作表明，在Omicron BA.1和BA.2中发现的突变至少在Omicron及其许多迭代成为“关注的变体”之前一年就已经作为相对较小的变体出现了。欧米克隆及其变体是去年冬天COVID-19大规模复苏的关键。

医学院病理学系教授Peter Zimmerman说:“全球研究界对病毒变异的大多数共识的集中，转移了人们对基因变异的注意力，而基因变异可能对COVID-19大流行的持续演变有重大贡献。”“专注于大多数变异是开发诊断、治疗和疫苗的关键第一步，然而需要量化和报告变化，以便公共卫生界和更好地准备和灵活地应对不断演变的病毒。”

在全球SARS-CoV-2不断演变的过程中，仍需对病毒谱系的出现进行定义和跟踪。为了节省时间，全球研究人员一直依赖于对相对主导的变化进行跟踪和报告。但CWRU的研究人员指出，鉴于单一感染中的多种变异，报告更完整的病毒基因序列表示非常重要，以了解这些基因变化如何传播，以及如何与不同类别的患者病情相互作用，包括逃避根除努力。

进一步探索

SARS-CoV-2暴发早期Omicron变异的遗传分化和多样性
更多信息:COVID-19感染和传播包括复杂的序列多样性，公共科学图书馆遗传学(2022)。Journals.plos.org/plosgenetics .pgen.1010200
期刊信息: 公共科学图书馆遗传学

所提供的凯斯西储大学
引用:研究表明，所有COVID-19感染都包括2022年9月15日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-09-covid-infections-wide-sars-cov-virus.html检索的SARS-CoV-2病毒变体(2022,9月8日)的广泛混合
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