前列腺肿瘤生物学可能受遗传祖先的影响

前列腺肿瘤生物学可能受遗传祖先的影响
样品采集地点和遗传混合物分析。答:在尼日利亚各地的临床地点,收集了45个样本。B, admix v1.3.0用于基于1000基因组计划III期超居群的参考居群估计祖先比例。在分析之前,将罕见的变异(即所有III期1000个基因组中<5%)、所有的索引和任何非双等位的snp去除。CaPTC队列样本中非洲人的平均比例为99.1%。>70%非洲血统的TCGA样本(n = 50)被归为AA;402 TCGA样品中含有60%欧洲掺合料>。这些样品按照欧洲比例进行排序,前50名的样品被归类为EA并用于本研究。欧洲人在这一群体中的平均比例为99.996%。C, NG和TCGA队列中的种系变异与III期1000个基因组超居进行了主成分分析比较。 NG samples strongly clustered with the African superpopulation. AAs samples clustered with the African superpopulation; European samples clustered with the European superpopulation. Credit:癌症研究通讯(2022)。DOI: 10.1158 / 2767 - 9764. - crc - 22 - 0136

在9月16日至19日举行的第15届美国癌症学会(AACR)癌症健康科学会议上,两项研究表明,在非洲裔男性前列腺肿瘤中发现的某些基因变异与非洲血统有关。

其中一项研究同时发表在该杂志上癌症研究通讯

在美国,黑人男性的自杀率最高有关的死亡率。两项研究的资深作者、塔斯基吉大学生物医学研究中心主任、美国癌症研究协会少数族裔癌症研究委员会主席Clayton Yates博士解释说,大多数研究的差异集中在种族上,这通常是自我报告的,由肤色和社会文化特征定义。bob88体育平台登录

然而,耶茨认为,解决健康差异还需要理解基因的作用.他解释说,对遗传祖先的洞察可以通过发现非洲血统患者的潜在治疗靶点来帮助精准医疗工作。

在第一项研究中,耶茨研究实验室的研究生、AACR下一代之星Isra Elhussin、MBBS、理学硕士和同事们研究了非洲血统对免疫炎症基因签名表达的影响,这些基因签名与非洲裔男性的高免疫原性和侵袭性前列腺癌相关。

Elhussin和他的同事先前报告说,非裔美国男性的前列腺肿瘤的炎症信号激活量是前者的两倍,这可能导致这些患者的疾病具有更强的侵袭性。

然而,Elhussin指出,非洲裔男性中与前列腺癌相关的较高死亡率并不局限于那些生活在美国的人。她说:“非洲裔男性在全世界与前列腺癌相关的死亡率最高,这表明这些不同结果可能是由祖先造成的。”

为了确定非洲血统在前列腺癌中的作用,Elhussin和同事对美国72名未接受治疗的患者的前列腺肿瘤进行了测序。在这些患者中,16名自称是非洲裔美国人,25名是欧洲裔美国人,1名是亚洲人,30名没有种族。通过参考数据库,Elhussin确定,大多数被认定为非裔美国人的患者具有与非洲裔男性一致的遗传标记,特别是那些班图亚人群(撒哈拉以南)和/或约鲁巴亚人群(尼日利亚)。

与欧洲血统患者的肿瘤相比,非洲血统患者的肿瘤更容易携带SPOP突变,a大约10-15%的前列腺癌会发生突变。Elhussin指出,SPOP突变之前与侵袭性前列腺癌有关。此外,Elhussin发现,非洲血统患者的SPOP突变与促炎免疫基因特征表达增加、免疫细胞浸润肿瘤增加、PD-L1和PD-1免疫检查点蛋白表达增加相关。

Elhussin说:“我们是第一个证明非洲遗传祖先与SPOP突变相关的,这导致了更高的免疫原性,免疫炎症信号的上调,表达衰竭标记的免疫细胞的更高肿瘤浸润,为非洲血统的男性中更高的前列腺癌相关死亡率提供了一个潜在的机制。”“这些发现对治疗前列腺癌有一定的意义,并可能导致使用消炎药和免疫调节剂的新治疗策略,以减少非洲裔男性的疾病负担。”

耶茨指出:“虽然大多数前列腺肿瘤没有免疫细胞浸润,但我们的研究结果表明,带有这种SPOP突变的前列腺肿瘤有非常高水平的免疫细胞浸润。”“这是一个令人兴奋的发现,它可能有助于识别将从免疫疗法中受益的患者,鉴于非裔美国人在评估此类疗法的临床试验中往往代表性不足,这一点尤为重要。”

在第二项研究中,该研究同时发表在癌症研究通讯, Yates和他的同事,包括第一作者Jason White, MS,比较了尼日利亚人,非裔美国人和欧洲裔美国人前列腺肿瘤的DNA序列。这项研究是与跨大西洋前列腺癌协会(CaPTC)合作完成的。

耶茨说:“我们的目标是了解基因组对尼日利亚男性前列腺癌的影响,这是以前从未研究过的。”“我们进行了测序,以确定是否有与尼日利亚人群相关的独特突变,与非裔美国人或欧洲裔美国人的肿瘤不同,并确定这些人群之间的任何相似之处。”

Yates, White和同事们对从尼日利亚患者中收集的45个晚期treatment-naïve前列腺肿瘤和11个不匹配的非肿瘤前列腺样本进行了测序。他们将这些序列与癌症基因组图谱数据库中来自非裔美国人和欧洲裔美国人前列腺肿瘤的现有数据进行了比较。

他们发现,尼日利亚人和非裔美国人前列腺肿瘤的基因变异相似,其中BRCA1 DNA修复基因的特定变异是在这两个人群中发现的最常见的变异。此外,研究人员确定,BRCA1突变的频率随着非洲遗传血统比例的增加而增加,而随着非洲遗传血统比例的降低而降低。

耶茨说:“我们在BRCA1基因中发现了独特的变异,这些变异通常不会在临床中进行检测,而且这些变异是非洲血统特有的。”“另一方面,来自欧洲裔美国人的肿瘤有不同DNA修复基因的变异,这在非裔美国人或尼日利亚患者的肿瘤中没有观察到。这表明,与非洲血统的男性相比,不同的变异导致了欧洲裔美国人的前列腺癌。”

耶茨解释说,这些发现可能会对非洲裔前列腺癌患者的治疗产生影响。他说:“目前在癌症中检测的BRCA变体是从非少数族裔人群中识别出来的,不包括我们所识别的非洲血统特异性变体。”他补充说,这有效地排除了许多非裔美国人,使他们无法接受针对BRCA的癌症治疗。

他补充说:“检测这些额外的变异将有助于确定更多符合brca靶向治疗条件的患者,并可能提供一些预后价值。”耶茨指出,未来的研究将致力于了解已识别的变异是如何促进前列腺癌的发展和进展的。

总之,这些研究强调了非洲血统对前列腺癌遗传的贡献,并可能解释前列腺癌患者中一些种族/民族的结果差异,介绍尼日利亚研究的怀特解释说在AACR差异会议上他补充说,表观遗传和社会因素也是导致癌症健康差异的重要因素。

Elhussin指出,这两项研究的局限性包括样本量小,来自少数种族/民族的生物标本稀缺,以及在基因组研究和现有数据库中非洲人代表性不足。

更多信息:Jason A. White等人,来自跨大西洋前列腺癌联盟(CaPTC)的尼日利亚前列腺肿瘤全外显子组测序揭示了与非洲血统相关的DNA修复基因,癌症研究通讯(2022)。DOI: 10.1158 / 2767 - 9764. - crc - 22 - 0136
引用:前列腺肿瘤生物学可能受遗传祖先的影响(2022,9月19日),2022年11月5日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-09-prostate-tumor-biology-genetic-ancestry.html检索
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