人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中是活跃的

人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中是活跃的
人体中的HML-2 ORF转录本:这张人体地图(经允许改编自GTEx联盟网站)显示了每个样本组织中可能表达的人内源性前病毒HML-2 ORF。蓝色代表Gag,绿色代表Pro,粉色代表Env,橙色/紫色分别代表Rec和Np9。方形表示从邻近基因或周围基因转录而来的表达,或其他不确定的表达。三角形显示LTR驱动的病毒ORF转录。这张图显示了可在全身非病变组织中转录的HML-2病毒orf的广泛范围。来源:Burn A等人,2022,PLOS生物学,CC-BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

美国波士顿塔夫茨大学的Aidan Burn及其同事10月18日在开放获取期刊上发表的一项研究表明,人类基因组中古老病毒的残余在健康组织和患病组织中都很活跃,限制了它们作为疾病生物标志物的用途公共科学图书馆生物学

精子或病毒感染会导致被永久地纳入而人类内源性逆转录病毒(HERV)这一古老病毒的遗传残留物约占人类基因组总数的8%.虽然不再具有传染性,一些HERV仍然含有完整的基因,并在HERV RNA转录物中产生与某些癌症有关。

然而,HERV在健康组织中的表达在很大程度上尚未被探索。为了解决这一知识鸿沟,研究人员使用基因型组织和表达项目的RNA序列数据来调查非患病组织中属于近期HERV亚群HML-2的转录本的存在。该数据库包括从近1000个个体中收集的54种不同组织类型的基因表达数据。作者在所有组织类型中检测到HML-2转录本,在小脑、垂体、睾丸和甲状腺组织中水平升高。

结果表明,HML-2活性并不局限于病变或癌变组织,这具有重要的临床意义。例如,使用HML-2表达作为癌症生物标志物或治疗靶标,需要考虑非病变组织中的背景表达。作者说,进化上更古老的HML-2病毒在人类组织中表现出最高的表达水平,这可能表明包含完整蛋白质编码序列的较年轻、降解程度较低的HERV片段的活性可能被细胞抑制,以防止有害病毒蛋白的产生。

资深作者约翰·科芬补充道:“我们发现几乎所有的情况都是正常的在它们的RNA中表达一种或另一种大约36种内源性前病毒,这是我们遥远祖先广泛感染的逆转录病毒的残余。我们希望这一发现为进一步研究这些元素在人类生物学和疾病中的作用提供基础。”

更多信息: 公共科学图书馆生物学(2022)。DOI: 10.1371 / journal.pbio.3001826
引用:人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中活跃(2022,10月18日),检索自2022年12月11日//www.pyrotek-europe.com/news/2022-10-ancient-viral-remnants-human-genome.html
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嵌入人类基因组的古老病毒元件并非来自化石逆转录病毒

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