观察表观遗传学在癌症行为中的作用

观察表观遗传学在癌症行为中的作用
eQTL基因表达的遗传控制。a,每种数据类型具有显著模型的基因数量。b,每种数据类型的回归系数(效应量)分布。c,d,火山图,突出对SCNA (c)和Mut eqtl (d)有意义的选定基因(线性回归双侧t检验;P邻接的, fdr调整的P值)。e,与非同义突变(NS)相比,增强子(Enh)突变往往具有较大的效应量和较高的正效应量比例。f,与顺式基因表达可检测变化相关的亚克隆突变的比例明显低于克隆eQTL突变。g, Fisher精确检测的可视化显示,如果基因突变组合与亚克隆突变的复发系统发育基因(在至少三种肿瘤中发现有系统发育信号的证据的基因)相关,则它们更有可能是eqtl,而这对克隆突变不显著。Phylo和Non-phylo表示基因在突变肿瘤中是否有系统发育信号的证据。双面Fisher精确检验,多次检验未校正的P值。信贷:自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 05311 - x

两个独立的研究团队进行了研究,以进一步了解表观遗传学在癌症肿瘤行为中所起的作用。第一组是英国癌症研究所(Institute of Cancer Research)的一个团队,他们与来自英国其他几家机构的同事合作,分析了来自不同患者的数千份肠癌样本,以寻找表观遗传变化的实例。

第二个团队的成员来自世界各地,他们专注于从同一肿瘤中提取的多个样本——他们也在寻找表观遗传学引起的变化。两个团队都在杂志上发表了概述他们工作的论文自然

多年来,医学科学家们一直相信,如果不是全部的话,大多数癌症的发生都是由于DNA突变,导致以肿瘤形式出现的异常组织生长。近年来,研究人员发现的证据表明,并非所有癌症都有简单的基因起源。相反,有证据表明,有些人有表观遗传因素。通过表观遗传学,年龄或环境对DNA编码的方式产生影响是表达。在这项新的研究中,两个团队都试图更好地理解表观遗传学在癌症肿瘤发生和进展中的作用。

在第一项研究中,研究人员收集并研究了不同类型的肠道组织收集自30个不同的病人。他们总共研究了1370份样本。每个人都进行了全转录本RNA-seq和全基因组测序。他们能够追踪到哪些肿瘤是纯DNA的,哪些不是。他们发现其中只有166个可以追溯到潜在的基因。

在第二项研究中,研究人员使用了空间解析、配对的全基因组和转录组测序从相同的。他们发现有证据表明,他们发现的大多数变异不能归咎于潜在的基因。

两个研究小组都承认,他们的工作并没有证明表观遗传学直接导致癌症行为的改变,但他们都发现了证明这一点的证据。他们还都指出,要更好地理解这一角色,还需要做更多的工作在癌症的发展和进展中起作用。


进一步探索

研究开发了识别癌细胞的新方法

更多信息:大肠癌进化的表型可塑性和遗传控制,自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 05311 - x

Timon Heide等,基因组和表观基因组在结直肠癌中的协同进化,自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 05202 - 1

期刊信息: 自然

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引用:查看表观遗传学在癌症行为方式中的作用(2022年,10月27日),检索自2022年10月28日//www.pyrotek-europe.com/news/2022-10-role-epigenetics-ways-cancer.html
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