独特的基因特征可以帮助预测化疗反应
弗朗西斯克里克研究所(Francis Crick Institute)的研究人员开发了一种方法，可以帮助预测肺癌患者是否会对化疗产生反应，这种方法是基于肿瘤中哪些基因被开启。
近年来，癌症研究人员增加了我们对特定基因突变如何影响肿瘤的发展、演变和对治疗的反应的理解。然而，仅仅突变的存在并不能提供肿瘤生物学的完整图景。
他们的研究发表在自然通讯本周，科学家们研究了肿瘤中不同基因的表达，哪些基因被打开或关闭。
专注于与RAS信号通路相关的基因，研究人员分析了包含这些基因活性信息的数据集癌症细胞．从这些数据集中，在人工智能的帮助下，他们编译了一个独特的基因签名84年基因．
当科学家们回顾了500多份数据时肺癌患者对于已经接受过化疗的患者，该基因特征能够正确预测哪些患者会受益于化疗，哪些患者不会受益于化疗。
克里克大学癌基因生物学实验室的联合第一作者和博士后研究科学家Sophie de Carné说:“随着提供许多癌症治疗方法，越来越多的药物在试验中，预测哪种治疗方法对特定患者的成功几率最高是一个挑战。因为我们知道RAS信号参与了各种耐药机制，我们希望我们的基因签名将有助于确定可以从特定治疗中受益的患者群体。
与此同时，要实现这一目标，还有很多工作要做。它需要在试验环境中进行测试，我们也在进行调整，希望能让它更容易部署。”
克里克大学癌基因生物学实验室的联合第一作者兼主要小组负责人Julian下行说:“我们的工作表明，RAS信号通路是解释为什么在癌症中发病的关键因素肺癌病人对化疗有不同的反应。这一途径中的基因表达水平比某些基因突变(包括KRAS基因突变)的存在更具决定性。”
克里克生物信息学和生物统计平台的第一作者兼副主任Philip East补充说:“多亏了先进的计算工具，我们可以利用大量现有的癌症数据。这项研究表明，这些数据集可以带来新的见解，有可能改善患者的结果。”
研究人员将继续这项工作，包括研究他们的基因签名是否也可以用来预测哪些患者最有可能从免疫治疗中受益。虽然这种基因签名针对肺癌进行了优化，但该方法也可以用于开发其他癌症的签名。
