抗生素对真菌菌群的影响因人而异

抗生素对真菌菌群的影响因人而异
22个健康个体2周内真菌菌群特征的动态变化。(A) 22名健康受试者在间隔1周时间点的真菌种类相对丰度。对于每个受试者,barplot按时间排序(抗生素前为−D15,−D7,−D1)。所代表物种的平均相对丰度达到1%以上。(B) Alpha多样性:22名健康受试者间隔1周时间点OTUs数量和Shannon指数值的小提琴图。(C) Beta多样性:ITS1测序数据中不同受试者捐赠样本之间(受试者之间)和同一受试者捐赠样本之间(受试者内部)的Bray-Curtis不相似值。取值范围从0到1,0是最小的不相似度,1是最大的不相似度。(D) 22名健康受试者白色假单胞菌DNA在间隔1周时间点的小提琴图和箱形图。每个点代表一个样本。对于所有面板,上须从铰链延伸至小于1.5×四分位数范围的最大值,下须从铰链延伸至大于1.5×四分位数范围的最小值。 Credit:mBio(2022)。DOI: 10.1128 / mbio.02880-22

抗生素治疗会破坏人体肠道内有益细菌和有害细菌的平衡。这种破坏会导致肠道真菌菌群中真菌物种的过度生长,包括常见的肠道酵母菌白色念珠菌。然而,研究人员对其潜在机制的了解有限。

本周在mBio,这是首次进行此类研究,欧洲的研究人员报告了一种常见的β -内酰胺抗生素治疗如何导致C。在病人。值得注意的是,他们发现并非所有患者的反应都是一样的,白色念珠菌数量增加的程度在很大程度上取决于个体的微生物群。这种变异表明白色念珠菌过度生长的风险对每个人来说都是不一样的。

法国巴黎巴斯德研究所的微生物学家、资深作者、医学博士玛丽-伊丽莎白·布格努说:“这项研究表明,情况比以前想象的要复杂得多,使用某些抗生素,如β -内酰胺,白色念珠菌的增加因人而异。”

研究人员长期以来一直在研究抗生素对但很少有人关注真菌菌群,或肠道的集合.这项新研究的作者指出了两个原因。

“首先,真菌菌群很难用宏基因组学技术进行研究,”该研究所的博士生、该论文的第一作者玛戈特·德拉维(Margot Delavy)说,“其次,真菌的浓度远低于细菌的浓度,”这使得它们更难测量。她说:“研究肠道真菌的可重复宏基因组技术直到最近才出现。”

在这项新研究中,Bougnoux和她的同事使用了追踪两组11名健康患者在使用头孢噻肟(一组)或头孢曲松(另一组)治疗前、期间和之后肠道真菌菌群的变化。这两种药物都是第三代头孢菌素抗生素。

研究小组首先确定了粪便DNA中与真菌种类有关的部分。然后,在抗生素治疗之前,他们使用高通量测序来确定志愿者健康肠道中存在哪些真菌种类。他们发现,物种的多样性和丰度不仅因人而异,而且在同一个体中,物种的多样性和丰度也不尽相同。研究小组使用特异性qPCR来量化白色念珠菌的水平,发现95%的参与者体内都存在这种真菌。

研究人员在抗生素治疗期间和之后进行了类似的分析。他们发现,在抗生素治疗后,所有患者的真菌负荷(粪便dna的比例)都有所增加。但在物种层面上,这些反应差异很大。一些个体经历了白色念珠菌和其他物种数量的显著增加,而另一些个体则没有。(至少有一名参与者甚至表现出了下降。)

对样本的进一步分析显示,真菌对抗生素治疗的反应变化与β -内酰胺酶的活性有关,β -内酰胺酶是由受试者微生物群中的内源性细菌产生的。与β -内酰胺酶水平较高的人相比,β -内酰胺酶水平较低的人会经历更多的真菌生长,包括白色念珠菌。

Bougnoux之前的工作主要集中在肠道白色念珠菌定植如何导致感染,他说该小组希望专注于因为这是殖民的主要风险因素。她指出,这项新研究是了解真菌菌群如何对治疗做出反应的有希望的第一步,但这只是一个开始。

Bougnoux说:“我们的研究是在只服用一种抗生素的人类志愿者身上进行的,但实际患者通常会服用几种抗生素。”她补充说,那些受到真菌感染最多的人最有可能患上真菌感染。“我们在这些患者中发现的β -内酰胺和肠道白色念珠菌定植减少之间的关系是否也成立,还有待观察。”

更多信息:Margot Delavy等人,一项临床研究提供了第一个直接证据,表明粪便β-内酰胺酶活性的个体间差异影响肠道真菌菌群对β-内酰胺抗生素反应的动力学,mBio(2022)。DOI: 10.1128 / mbio.02880-22
期刊信息: mBio

引用抗生素对真菌菌群的影响因人而异(2022年11月30日),检索自2022年12月27日//www.pyrotek-europe.com/news/2022-11-antibiotics-effect-mycobiome-vary-person.html
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