第一个证据表明耐药细菌可以从肠道传播到肺部，增加感染风险

牛津大学在世界抗菌素意识周期间发布的一项新研究对抗菌素耐药性(AMR)是如何产生和持续的有重要发现。研究结果发表在今天的自然通讯，首次提供了AMR细菌从患者肠道微生物群迁移到肺部，增加致命感染风险的直接证据。

由牛津大学生物系领导的研究小组表示，应用这些发现可以挽救生命，因为它强调了预防的重要性病原菌从肠道转移到其他器官，从而导致严重感染。

这项研究是在一名携带铜绿假单胞菌的患者身上进行的，该患者的肠道微生物群中含有铜绿假单胞菌。这种细菌是医院感染的主要原因之一，而且对抗生素的抵抗力特别强。当假单胞菌嵌入健康的肠道微生物群时，通常不被认为是危险的，但它可以导致住院患者肺部的严重感染。

在住院期间，患者因疑似尿路而使用抗生素美罗培南治疗感染(泌尿道感染)。美罗培南治疗导致肠道内无耐药性细菌肺被杀死，假单胞菌的耐抗生素突变体得以生长和增殖。然后发现假单胞菌在抗生素治疗期间从肠道转移到患者的肺部，在那里它进化出更高水平的抗生素耐药性。

“医院获得性感染是抗生素耐药性的最大负担之一。我们的工作表明，来自患者自身肠道微生物群的致病菌可以传播到肺部，在那里它们可能导致难以治疗的感染。这些发现强调了从住院患者的肠道微生物组中消除AMR细菌的重要性，即使它们没有引起感染，”生物系Craig MacLean教授说。

随着AMR越来越受到医院的关注，防止AMR细菌传播到其他医院重要器官比如肺部对脆弱的病人至关重要。然而，导致这些严重感染的细菌的来源很难确定。这项研究显示了肠道微生物组如何充当AMR病原体的储存库，这些病原体可以转移到肺部，在那里它们有可能导致危及生命的疾病，如肺炎。

这项研究的结果表明，从住院患者的肠道微生物组中消除AMR病原体有助于预防严重感染，并强调了抗生素使用如何对实际上不是抗生素治疗目标的细菌产生深远影响。

研究人员在患者住院期间对他们进行了测试，以跟踪他们感染假单胞菌的持续时间。他们使用遗传方法，创建了一个经过时间校准的细菌家谱，使他们能够分析感染的进展和位置，以及它的进化。他们还在肠道中发现了高度的遗传多样性，这也表明微生物组可能是抗生素耐药性产生的蓄水池。

幸运的是，这个病例中的病人有一个免疫反应以防止感染导致肺炎。然而，许多处于危急状态的人，特别是在冬季，免疫系统较弱，这意味着身体抵抗疾病的能力较弱。抗生素耐药性政策通常侧重于减少来自外部的感染，但了解抗生素耐药性如何在患者体内发展和传播同样至关重要。

研究人员现在打算通过从更大的队列中收集样本来评估脆弱患者肠道到肺部细菌易位发生的频率。

该研究的主要作者Craig MacLean教授(生物系)说:“显然需要开发新的方法来应对抗菌素耐药性带来的挑战。我们的研究表明肠肺易位和抗生素的使用可以结合起来推动抗生素耐药性在单个患者中的传播。为了开发新的干预措施来预防耐药感染，需要这样的见解。例如，我们的研究强调了消除AMR细菌(如铜绿假单胞菌)的潜在好处肠道微生物组即使这些细菌实际上并没有引起感染。”