基因交互分类肠道肿瘤的个性化医疗

肠道癌症可以分为六个临床有意义的基于模式的基因亚型交互常见肿瘤细胞内,根据今天公布的一项研究eLife。

这个新分类法的肠癌援助对该病的了解和最终可能会被医生用于精密medicine-helping裁缝个别病人的最佳治疗方法。

“目前,疾病分期是用来指导肠癌患者的临床管理,但这是不够的,因为可以实质性肿瘤之间的差异在一个类似的阶段,“陆Zaoqu第一作者解释说,主人在郑州大学第一附属医院,郑州,中国。

肠癌的“更详细的分子分类更有效,但它仍然是基于快照的基因活动水平在一个肿瘤在一个时间点(例如,在活组织检查),而不反映基因活性的动态变化以及如何基因相互作用”。

相比之下,生物交互网络,每个基因通常与另一端的地图相对稳定不分时间和可以更可靠地描述组织。此外,在正常基因的相互作用是高度保守的组织但在疾病广泛地改变了。通过量化为不同的基因对“交互变化”,就有可能比较整体病变组织中基因的相互作用的变化,与正常组织背景水平。

团队应用这种基因相互作用网络(杜松子酒)方法使用超过2000肠癌组织样本和308正常肠组织样本构建一个大型网络的变化基因的相互作用。使用网络,他们可以分成六个组肠道癌症亚型,每个都有不同的临床和分子特征。功能包括重要的肿瘤特征,如肿瘤细胞的比例细胞类型,是否癌症细胞类似于干细胞,它可以影响肿瘤生长和扩散的可能性。

杜松子酒的分类与不同immunogenicity-that还发现了组织,可能是肠道肿瘤组织是如何刺激免疫反应,这是决定病人是否会对免疫治疗的关键。其他有用的特性包括可能的预后、抗放射治疗和免疫疗法治疗,可能性的敏感性不同的化疗药物只能可以帮助调整治疗。杜松子酒的方法测试时在19进一步肠癌的数据集,同样的六个亚型都确认。

第一个杜松子酒是基于2000多近1400个基因之间的相互作用,并导致分类器基于289个基因。这是不可能的测试临床临床提供快速访问工具,随机选择的团队减少了分类器14-gene mini-classifier。当他们使用mini-classifier于214年的一个子集肠癌样本,他们发现它是稳定完整分类器在确定六个肠癌亚型。

“我们的研究已经确认和验证一个高分辨率的分类系统,可以作为一种工具优化肠癌患者的治疗决策,”资深作者鑫威汉说,介入放射学教授和主任,郑州大学第一附属医院,郑州,中国。

“下一步将确定的生物和临床可解释性六肠癌亚型在未来的临床试验,但我们相信,这一新的分类可以促进更有效的个性化治疗的患者肠癌。"