个性化的全基因组测序使罕见疾病的诊断加倍

伦敦大学学院的研究人员领导的一项新研究发现，针对单个患者定制全基因组测序分析可以使罕见疾病的诊断率翻倍。

2018年，英国卫生部宣布了NHS基因组医学服务，允许患者使用罕见疾病读取他们的全部基因密码希望能提供他们急需的诊断．

然而，这种数据的解释可能是极具挑战性的，许多人与复杂，罕见遗传疾病仍然没有收到一个分子的答案，他们的问题的原因。

这项研究发表在自然通讯伦敦大学学院皇后广场神经学研究所伦敦线粒体中心和伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所的研究人员试图为这类患者提供更好的接受基因诊断的机会。

为此，他们测试了如何使用由专家医生、生物信息学家和科学家组成的基因组医学团队来提高NHS诊断实验室的能力，而不仅仅是标准的半自动数据分析。伦敦大学学院的团队重新评估了未确诊的病例，以确定可能有助于指导进一步的、更个性化的分析的线索。他们随后应用了额外的生物信息学方法，使用先进的计算机技术来识别患者DNA中的基因改变，这些改变可能导致疾病，但在常规检测中被忽略了。

这项研究包括102名未确诊的患者，他们怀疑患有原发性线粒体疾病(一大批无法治愈的遗传疾病，影响儿童和成人，与广泛的医疗问题、严重残疾和寿命缩短有关)，他们通过NHS的10万基因组计划进行了全基因组测序。

这种个性化的方法将诊断率从16.7%提高到31.4%。它还在另外3.9%的患者中检测到潜在的致病变异。

首席作者Robert Pitceathly博士(伦敦NHS罕见线粒体疾病高度专门服务的联合负责人，伦敦大学学院皇后广场神经学研究所的研究小组负责人)说:“NHS在先进的基因技术上投入了大量资金。因此，英国已经在诊断全基因组测序的前沿确立了自己的地位。尽管如此，一些患有罕见遗传疾病的人仍然没有基因分子诊断在他们的基因组被分析之后。

“我们相信，投资于专业基因组医学团队是至关重要的，这可以确保公平获得专门的多学科专业知识，并使诊断最大化。在我们的研究中，患者平均等待诊断超过30年——我们现在有能力解决这类病例，但需要足够的人力规划来支持NHS诊断基因实验室实现这一目标。”

接受基因诊断很重要，因为它允许患者获得计划生育、专门的体外受精和药物试验。它还可以对已知的疾病并发症进行有针对性的筛查，并进行药物研究。

Pitceathly博士说:“在这项研究中，每一个新的基因诊断对病人的护理有直接影响。这包括额外的心脏问题、听力损失和糖尿病检查，并获得临床试验．"

伦敦大学学院皇后广场神经学研究所主任迈克尔·汉纳教授说:“这项工作在为患者开发最大化基因组分析益处的最佳方法方面向前迈出了重要一步。”它清楚地表明，通过将基因组分析的自动化方法与熟练的多学科团队的数据解释相结合，诊断率翻了一番。这是一个重要的发现，它将影响基因组医学诊断服务在全球范围内的发展。”

研究报告的合著者詹姆斯·戴维森博士(大奥蒙德街医院代谢医学系、英国遗传代谢疾病小组主席)说:“为儿童和成人诊断罕见、复杂、医疗条件这可能是一个非常漫长的过程，而基因组医学为帮助实现这一目标提供了变革性的强大工具。

“这项研究强调了临床专家和遗传科学家之间合作的重要性，以解释基因组测序的结果，最大限度地提高诊断的机会，然后帮助指导医疗管理而且治疗方案．"

病人的故事

瑞秋·诺斯(Rachel North)是参与试验的患者之一，她称得到诊断“改变了生活”。这使得她可以接受疾病并发症的筛查，比如骨质减少，这些都得到了治疗。

她说:“在过去的20年里，我去过很多医院，找了这么长时间，我从来没有想过我会得到诊断。

“想这件事花了我很多精力，我很担心我12岁的儿子，担心我的病情会不会影响他。因此，得到罕见的隐性诊断是一种解脱，消除了对未知的恐惧。

“有了诊断，我可以研究我的病情，并非常积极地管理它。

“任何能帮助我理解和理解我身体发生的变化的东西，都能帮助我接受它，并让我相信我在尽可能地控制它。”