研究人员识别潜在的癌症风险增加相关的遗传变异的孩子出生缺陷

费城儿童医院的研究人员(切)已经发现了几个与儿童癌症的风险增加相关的遗传变异与non-chromosomal出生缺陷、先天性心脏病和缺陷等中枢神经系统。虽然罹患癌症的风险不是高达染色体出生缺陷的儿童,这是明显高于孩子没有出生缺陷,和早期检测的结果可能会提供一个基础在这些可以理解病人。

研究结果最近发表在《华尔街日报》生物标志物的研究。

出生缺陷的儿童更容易患癌症,这增加了患癌症的风险会延续到成年阶段。先前的研究已经证明了这一点孩子们与染色体出生缺陷,如唐氏综合症和Klinefelter综合症,超过11倍更有可能被诊断为癌症儿童出生缺陷。然而,non-chromosomal儿童出生缺陷是2.5倍更有可能被诊断为癌症比那些没有出生缺陷。任何形式的出生缺陷发生在1每33出生在美国,每年增加的风险影响相当数量的孩子。

non-chromosomal出生缺陷的潜在基因没有被详细研究。应用基因组学研究中心(CAG)切想确定分子机制都在玩,可能识别遗传线索可能导致癌症在这些患者的早期识别。

“我们聚集最大的儿科肿瘤学和儿童出生缺陷项目的加布里埃尔·米勒孩子第一个程序项目,这有助于发现新的洞察儿童癌症和先天缺陷,”汉康·汉科纳森说,医学博士,博士,CAG主任剁碎,这项研究的资深作者。这种伙伴关系,我们试图确定功能基于突变的分子途径我们确认,作为这项研究的一部分。”

在这项研究中,研究人员使用的数据从全基因组测序获得的血液样本1653人没有染色体异常,从孩子们获得的第一个数据资源中心。这些样本包括541名出生缺陷probands-the家庭中第一个获得遗传咨询或遗传疾病的风险测试至少一种恶性肿瘤,767出生缺陷渊源者没有恶性肿瘤,345名健康家庭成员是上述渊源者的父母或兄弟姐妹。此外,发现变异之后,全基因组测序数据从40出生缺陷渊源者从外部数据资源中心,包括25名患者至少一种类型的癌症,被用来进一步验证研究。

感兴趣的研究发现成千上万的变异,包括与至少两个119个基因变异基因的编码regions-regions最终将转录和翻译成蛋白质执行基本功能和与至少20 478个基因变异在非编码区域。五个基因particular-AXIN2、BMP1 CR1、ERBB2, RYR1-are与出生缺陷和癌症的风险增加有关。此外,研究人员建立了深度学习模型来评估感兴趣的变异发现在孩子们第一次队列相比,40验证样本,发现他们已经达到大约75%的准确率,为更大的准确性与非编码区域的变异。

进一步详细分析这些数据不仅可以识别基因和非编码基因突变导致特定的出生缺陷,但也确定哪些类型的癌症,他们更倾向于和风险是否在童年和成年。

“虽然还需要更多的研究来深入研究感兴趣的变量我们发现,这项研究是关键一步的早期检测癌症儿童non-chromosomal出生缺陷”,Hakonarson说。