世界上最大的自闭症全基因组测序研究揭示了134个自闭症相关基因
在迄今为止最大的自闭症全基因组测序分析中,来自患病儿童医院(SickKids)的研究人员发现了与自闭症谱系障碍(ASD)相关的新基因和遗传变化,更好地理解了这种障碍背后的“基因组结构”。
这项研究今天发表在细胞,使用全基因组测序(WGS)来检查超过7000个人的整个基因组自闭症还有另外13000个兄弟姐妹家庭成员.研究小组发现了134个与自闭症谱系障碍相关的基因,并发现了一系列基因变化最显著的是基因拷贝数变异(CNVs),可能与自闭症有关,包括asd相关罕见变异大约14%的自闭症患者。
大部分数据来自自闭症之声MSSNG数据库,这是世界上最大的自闭症全基因组数据集,它为自闭症研究人员提供免费的、开放获取成千上万的测序基因组。
“通过对所有参与者的整个基因组进行测序,并在MSSNG参与家庭的深度参与下形成我们的研究重点,我们最大限度地发挥了发现的潜力,并允许分析涵盖所有类型的变异,从最小的DNA变化到影响整个染色体的变异,”Stephen Scherer博士说,他是SickKids的高级科学家、研究主管和多伦多大学麦克劳克林中心主任。
这篇论文的主要作者、SickKids遗传与基因组生物学项目的研究助理Brett Trost博士指出,WGS的使用使研究人员能够发现原本无法检测到的变异类型。
这些变异类型包括复杂的DNA重排,以及串联重复扩增,最近SickKids关于自闭症和重复多次的DNA片段之间联系的研究支持了这一发现。研究还检查了母亲遗传的线粒体DNA的作用,发现占自闭症的2%。
这篇论文还指出了只有一个自闭症患者的家庭与有多个自闭症患者的家庭(即多重家庭)在自闭症遗传学上的重要细微差别。令研究小组感到惊讶的是,“多基因得分”——一种对个体患有自闭症可能性的估计,是通过汇总整个世界中数千个常见变异的影响来计算的基因组-在多重家庭中并不高。
“这表明,在多重家庭中,自闭症可能更有可能与遗传自父母的罕见的、具有高度影响力的变异有关。因为与自闭症相关的遗传学和临床特征都是如此复杂和多样,像我们使用的这样的大型数据集对于为研究人员提供更清楚地了解自闭症的遗传结构至关重要,”Trost说。
研究小组说,这项研究数据可以帮助扩大对可能与自闭症谱系障碍有关的变异范围的调查,以及更好地了解85%的自闭症患者的遗传原因仍未解决的因素。
在一项针对纽芬兰325个ASD家庭的相关研究中自然通讯在美国,舍勒博士的团队发现,同一个人身上自发、罕见遗传和多基因遗传因素的组合,可能会导致自闭症的不同亚型。
苏珊娜·刘易斯博士是BC儿童医院研究所的遗传学家和调查员,她诊断了许多参与研究的家庭,她说:“总的来说,这些最新的发现代表着在更好地理解与ASD相关的复杂遗传和生物回路方面向前迈出了一大步。这一丰富的数据集也提供了一个机会,让我们更深入地研究可能决定个人患上这种复杂疾病几率的其他因素,以帮助制定个性化的未来治疗方法。”
Ada J. S. Chan等,全基因组罕见变异评分与自闭症谱系障碍的形态学亚型相关,自然通讯(2022)。DOI: 10.1038 / s41467 - 022 - 34112 - z