发现了与CHIP相关的新的基因组变异

发现了与CHIP相关的新的基因组变异
每个CHIP亚型的表型组关联概况。每个CHIP基因亚型的图谱反映了全现象关联结果。的y-轴(同心圆)表示一个性状类别中名义上相关的表型(P≤0.05)具有CHIP基因的载体状态。CHIP基因必须至少具有一种相关表型比例≥0.2的疾病类别才能纳入图中。正如预期的那样,血液学性状总体上显示出最大比例的表型性状关联。最多的癌症关联被发现DNMT3A芯片,而JAK2CHIP显示心血管相关比例最高。呼吸相关性最明显ASXL1芯片。SUZ12CHIP在CHIP亚型中表现出独特的特征,与眼科和内分泌相关的比例更高。关联模型与年龄、年龄相关2,性别和年龄×性别,十个祖先信息主成分为协变量。信贷:自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 05448 - 9

Regeneron制药公司的一组研究人员发现了与不确定潜能克隆造血(CHIP)相关的新的基因组变异。

在他们发表在杂志上的论文中自然该小组描述了他们如何使用全外显子和全基因组关联分析来研究一些患有糖尿病的人血液中的差异自然还在同一期杂志上发表了一篇研究集锦,讨论了纽约团队所做的工作。

造血是一个形成细胞血液成分的过程。克隆性造血是参与细胞谱系发展的过程的一部分。每个人一生中每天都会产生大约3000亿个新血细胞,这一事实突显了整个过程的重要性。

先前的研究表明,在某些人中存在与不确定潜力的克隆造血相关的变异,每种变异都可能产生独特的影响。在这项新的努力中,Regeneron的团队试图通过研究英国生物银行和盖辛格MyCode社区健康计划等大型数据集中的信息来找到其中的一些。

为了找到他们所追求的变异,研究人员将他们的搜索工作集中在已经与CHIP相关的23个基因上。通过搜索628,388人的数据,他们能够确定40,208人至少携带一种病毒与CHIP有关。然后,他们对已经确定的携带者进行了外显子范围和全基因组范围的研究。通过这样做,他们能够识别出24个以前没有见过的位点21。

研究人员还发现,他们能够在某些个体中识别出一些可能与克隆造血和端粒长度有关的变异。

在他们研究的另一部分,研究小组分析了英国生物银行中列出的人的健康特征,寻找具有CHIP变体的人与其他问题之间的联系。在此过程中,他们发现了具有克隆造血变异的人与COVID-19等疾病之间的联系,肥胖和各种类型的感染清除问题。他们还发现了CHIP患者与恶性肿瘤和髓系白血病发展之间的联系。

更多信息:Michael D. Kessler等,与克隆造血表型相关的常见和罕见变异,自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 05448 - 9

科斯蒂·明顿,对克隆造血的遗传病因的研究,自然评论遗传学(2022)。DOI: 10.1038 / s41576 - 022 - 00565 - 7

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引用:发现与CHIP相关的新基因组变异(2022,12月20日),检索于2022年12月22日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-12-genomic-variants-chip.html
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