一项自上而下的等基因人非转移性和转移性结直肠癌细胞系的研究

一项自上而下的等基因人非转移性和转移性结直肠癌细胞系的研究
实验设计示意图。(A)使用cce - esi -MS/MS和lc - cce - esi -MS/MS对转移性(SW620)和非转移性(SW480) CRC细胞进行TDP研究的原理图设计,用于检测蛋白样ID和LFQ。(B)本工作中四种基于cce - ms / ms的策略与蛋白质起始材料的量。信贷:科学的进步(2022)。DOI: 10.1126 / sciadv.abq6348

来自密歇根州立大学、印第安纳大学、俄亥俄州立大学和杜兰大学的一组研究人员对等基因人类非转移性和转移性结直肠癌细胞系进行了自上而下的蛋白质组学研究。

在他们发表在杂志上的论文中科学的进步该小组描述了他们如何使用TopPIC分析软件和电泳串联质谱分析结直肠细胞系中的蛋白质细胞和他们的发现。

先前的研究表明,癌症的问题通常不是癌变肿瘤的发展;相反,当它们转移时,就会出现严重的问题。正因为如此,一直在寻找可以检查的标记物,以确定特定的患者是否患有特定类型的癌症,而且是否已经转移。

在这项新的研究中,研究人员开发并实施了一种自上而下的方法来研究与转移性和非转移性结直肠癌发展相关的蛋白质,以及它们作为疾病标志物的可能用途。

研究人员的工作包括分析数千种蛋白质和蛋白质形态(一种特定类型的蛋白质))使用一种名为TopPIC的软件产品来寻找与结直肠癌的关联。他们也怀着同样的目标进行了质谱研究。该团队使用的独特方法使他们能够直接测量仍然完整的蛋白质形态,从而研究它们的特定功能。

总之,研究小组分析了23622种蛋白质形态和2332种蛋白质,并发现他们能够精确定位可用于区分转移性结直肠癌的变体。他们还能够识别约17300种与非转移性结直肠癌相关的蛋白质形态。研究人员还发现,这两种细胞系都具有与特定类型的信号和酶相对应的蛋白质形态。

研究人员总结说,他们的工作清楚地证明了这一点转移性和非转移性结直肠癌具有非常不同的蛋白质形态谱。他们进一步指出,这些档案可能代表生物标志物,可能很快就会在针对它们开发的新型测试中被寻找,作为测试的一部分

更多信息:Elijah N. McCool等人,深度自上而下蛋白质组学揭示了转移性和非转移性结直肠癌细胞之间的显著蛋白质形态水平差异,科学的进步(2022)。DOI: 10.1126 / sciadv.abq6348
期刊信息: 科学的进步

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引用:一项自上而下的等基因人类非转移性和转移性结直肠癌细胞系的研究(2022年12月27日),检索自2022年12月28日//www.pyrotek-europe.com/news/2022-12-top-down-isogenic-human-non-metastatic-metastatic.html
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