自上而下的研究同基因的人类non-metastatic和转移性结直肠癌细胞系

从密歇根州立大学的一组研究人员,印第安纳大学,俄亥俄州立大学和杜兰大学,进行了自顶向下的蛋白质组学的研究同基因的人类non-metastatic和转移性结直肠癌细胞系。

在他们的论文发表在杂志上科学的进步,描述了他们如何使用TopPIC分析软件和electrophoresis-tandem质谱分析蛋白质从结肠癌细胞系癌症细胞和他们的发现。

先前的研究已经表明,它不是一般的发展恶性肿瘤与癌症是有问题的;相反,它是当他们转移严重的问题发生。正因为如此,bob88体育平台登录医学研究人员一直在寻找标记,可以检查以确定一个给定的病人不仅给定类型的癌症,它是否已经转移。

在这个新的工作,研究人员已经开发和自顶向下的方法进行研究与开发相关的蛋白质转移和non-metastatic结直肠癌疾病及其可能的作为标记。

的工作人员参与分析成千上万的蛋白质和proteoforms(一个特定类型的蛋白质)使用一种称为TopPIC寻找关联的软件产品和结肠直肠癌。他们也有相同的目标,进行了质谱分析研究。独特的团队允许他们使用的方法直接测量proteofoms仍然完好无损,允许研究的特定功能。

所有的团队分析了23622 proteoforms和2332蛋白质和这样做发现他们能够确定变异,可以用来区分转移性大肠癌的形式。他们也能够识别大约17300 proteoforms non-metastatic直肠癌。研究人员还发现,这两个细胞系proteoforms,对应于特定类型的信号和酶。

研究人员得出结论,显然表明他们的工作证明细胞系从转移和non-metastatic直肠癌proteoform概要文件不同。这样的资料,他们进一步建议,可以代表生物标志物,可能不久的将来寻找新类型的测试开发目标,作为测试的一部分结肠直肠癌。