基因表达研究揭示了肥胖的新分子关联
科罗拉多大学医学院生物医学信息系(DBMI)的一项新研究确定了45个基因的基因表达与身体质量指数(BMI)相关,其中许多基因之前在肥胖研究中没有被探索过,此前研究人员使用多种族队列进行了一项研究。
他们的研究“动脉粥样硬化多种族研究中基因表达与体重指数的关系”发表在《美国医学杂志》上国际肥胖杂志,指出了肥胖潜在的新的生物标志物。该团队通过利用最初在2000年收集的一个大型、多样化队列的数据来实现这一目标。
“到目前为止,很少有关于BMI的遗传研究在不同祖先的人群中进行,”主要作者卢西亚娜·巴尔加斯解释说。“我们研究的新颖之处在于使用了直接测量基因表达数据。”
Vargas是一名对个性化医疗感兴趣的CU医学院博士生,他说这些已知的和新颖的基因关联可以为肥胖生物学、潜在的生物标志物和治疗靶点提供见解。
在他们的研究中,伊森·兰格博士和莱斯利·兰格博士的DBMI实验室的研究人员利用了动脉粥样硬化多种族研究(MESA)的数据。当MESA启动时,它招募了6000多人,从全国各地的六个实地中心招募,来进行研究风险因素以及心血管疾病的早期特征。参加者继续定期向外地中心报告收集健康数据。
由于研究人群众多,种族多样化,以及收集的健康信息数量众多,研究人员已将其数据用于大量研究。2014年成立的精确医学跨组学(TOPMed)联盟开始收集MESA参与者子集以及许多其他队列参与者的基因表达和其他组学数据。
“我们使用了MESA队列,因为很难找到一个定义明确的队列,有很多良好的临床测量,获得资金,并与研究参与者保持联系,以收集血液,并随着时间的推移进行这些研究,”Iain Konigsberg博士说,他是一位生物医学信息学研究讲师,在DBMI Lange实验室与Vargas合作。
研究人员分析了四个自我识别的种族和种族的RNA测序数据民族在MESA队列中——非裔美国人、华裔美国人、西班牙裔美国人和白人——评估每种基因表达对BMI的影响。许多与心血管风险相关的特征也与肥胖相关,从而形成了MESA队列非常适合肥胖症研究。
他们发现的45个基因在所有四组中都与BMI相关。而这其中的一小部分基因已通过遗传关联研究确定,CU的作者报告了许多新的关联。
柯尼斯伯格说,他们的工作表明肥胖研究需要更多的多样性,并希望这项研究的结果能够为更多的下游研究提供信息。他希望继续使用MESA和其他人类队列进行研究。对巴尔加斯来说,这是合作研究的宝贵经验,她于2021年秋季开始在CU安舒茨大学学习,是人类医学遗传学和基因组学项目的博士生。这是她作为研究生和莱斯利·兰格实验室成员的第一篇论文。
她说:“TOPMed联盟在全美范围内招募了数千人,加入该联盟为研究提供了新的机会。”“我非常欣赏合作的力量。”
更多信息:在动脉粥样硬化的多种族研究中,基因表达与体重指数的相关性,国际肥胖杂志(2022)。DOI: 10.1038 / s41366 - 022 - 01240 - x