先进的计算表明，目前的抗体对SARS-CoV-2变体XBB.1.5有效

北卡罗来纳大学夏洛特分校计算智能预测健康和环境风险中心(CIPHER)和夏洛特基因组学咨询公司Tuple的一个团队使用人工智能快速评估了新出现的SARS-CoV-2 XBB.1.5变种对公共卫生的影响。该团队进行的模拟结果表明，我们目前库存的抗体可以有效中和SARS-CoV-2 XBB.1.5。这篇文章可以在bioRxiv预印服务器

这种变体最近在美国引起的COVID-19感染中所占的比例有所增加，引发了对潜在医疗危机的担忧。然而，变异的传播能力增加并不意味着它是不可治疗的。

CIPHER和Tuple团队已经将几种技术结合在一起，以提供快速的健康情报，这是一个好消息。越来越清楚的是，通过新的科学和努力工作，我们可以解决紧急疾病，”CIPHER中心联合主任、卡罗尔·格罗特内斯·贝尔克生物信息学和基因组学杰出教授丹尼尔·詹尼斯说。

该团队使用机器学习应用程序进行模拟蛋白质结构抗体结合。通过这种方式，他们测试了各种抗体，包括由omicron增强疫苗诱导的抗体和其他用于治疗的抗体。

这些结果与该团队在一年前最初的omicron变体出现时所发现的结果形成了对比。在2021年，该团队正确预测了原始疫苗和抗体库对omicron的效力降低。

在这个团队工作的时候计算模拟在变体和抗体的数字表示上，工作非常快。该团队使用了来自AlphaFold2程序的蛋白质结构，然后是一个名为HADDOCK的程序，将抗体与SARS-CoV-2 XBB.1.5和相关病毒的Spike蛋白中的变体受体结合域对接。该评估基于物理模型，以测试对接质量，并预测抗病毒抗体的维持或减弱效果。

计算工作在传统化学实验室必须完成的结构和结合实验之前进行了数周。CIPHER研究人员利用新工具以及北卡罗来纳大学夏洛特分校的先进计算能力，为卫生官员对新型冠状病毒的崛起可以期待什么提供了有价值的早期迹象变体以及有效的治疗方法和疫苗。

同行评议的omicron论文《SARS-CoV-2 omicron变体(B.1.1.529)刺突蛋白受体结合域结构和中和抗体相互作用的预测》使用了相同的方法，并于去年发表在《美国医学杂志》上病毒学前沿可以找到在这里．