如何补偿基因功能的丧失?考虑替代拼接

如何补偿基因功能的丧失?考虑替代拼接
表达MBNL2(+E6)和MBNL2(-E6)的单个COSM6细胞的免疫荧光图像。外显子6的包含产生了预测的核定位信号。用DAPI(蓝色)、抗flag(绿色)和抗myc(红色)抗体对细胞进行染色。信贷:核酸研究(2023)。DOI: 10.1093 / nar / gkac1219

生物体在面对挑战时有一种坚持下去的本领。例如,当基因出现故障时,生物体可能会通过激活具有相似功能的冗余基因来进行补偿,这些冗余基因被称为“平行基因”。

这种补偿的一个例子是两个rna结合蛋白的肌盲(MBNL)家族的基因,它们在肌强直性营养不良1型中失去功能,这是成人发病的最常见原因.MBNL1的缺失会增加其副产物MBNL2在组织中的水平低,允许MBNL2功能补偿MBNL1的损失。在动物模型中,失去一个旁系细胞不会或只会导致轻微的功能后果,而失去两个旁系细胞则会导致严重的疾病和致命。

一篇关于这个主题的论文发表在杂志上核酸研究

“尽管这种对基因功能损失的补偿形式已被广泛观察到,但潜在的分子机制和在预防或修饰中的作用还没有被很好地理解,”第一作者拉里萨·尼奇克博士说,她是贝勒医学院托马斯·a·库珀博士实验室的病理学和免疫学博士后。“在这项研究中,我们发现了MBNL1的缺失如何导致MBNL2的代偿性增加."

MBNL蛋白深度参与RNA加工,包括这一过程允许细胞从有限数量的基因中制造许多不同的蛋白质。

为了制造蛋白质,DNA中的基因被转录成RNA,然后被翻译成蛋白质。在RNA被翻译成蛋白质之前,它被处理,片段以某种方式拼接,”库珀,R.克拉伦斯和艾琳H.富布赖特主席和S.唐纳德格林伯格病理学主席说。他也是该著作的通讯作者。“几乎所有的, RNA以不止一种方式拼接。这就是可选拼接;它允许一个基因制造许多不同的蛋白质。这就像将有限数量的珠子以独特的方式组合成不同的手镯一样。”

如何补偿基因功能的丧失?考虑替代拼接
MBNL1的缺失会增加骨骼肌、心脏和大脑中的MBNL2蛋白水平,但不会增加RNA水平。MBNL1的(A)骨骼肌、(B)心脏和(C)大脑中MBNL1和MBNL2蛋白和RNA水平的代表性western blot和定量+/+(WT)和Mbnl1 / 老鼠。对于western blot定量,MBNL1和MBNL2蛋白水平归一化为温库素。注意,我们发现所使用的MBNL1抗体与MBNL2(数据未显示)发生交叉反应,我们认为MBNL2是MBNL1中的残留条带 / 组织。RT-qPCR定量时,Mbnl1和Mbnl2 RNA水平归一化至Gapdh。对于每个试验,至少进行4次重复。简单比较使用学生t检验。其中,**、***、****和ns分别表示P < 0.01、P < 0.001、P < 0.0001和P > 0.05。所有数据以均值±SEM表示。信贷:核酸研究(2023)。DOI: 10.1093 / nar / gkac1219

Nitschke、Cooper和他们的同事发现,MBNL1的缺失导致了MBNL2的形成,其中有两个新的片段被剪接到它上面,称为外显子6和外显子9。

Nitschke说:“这些外显子的加入赋予了MBNL2新的特性,使其能够弥补MBNL1功能的缺失。”“外显子6的包含促进了MBNL2更有效地转运到细胞核中,在细胞核中这种蛋白质执行其功能。添加外显子9使蛋白质更不容易降解,更稳定,这使它能够有效地补偿MBNL1功能的丧失。”

贝勒丹·邓肯综合癌症中心的库珀说:“我们的发现也可以解释这种疾病在特征方面的高度可变性。”“即使在同一个家庭中,1型肌强直性营养不良症也可能非常严重或轻微。实施这些补偿措施的能力的个体差异可能解释了严重程度的差异。”

“代偿机制的发现也支持进一步的研究,如果类似于脊髓性肌萎缩的剪接增强药物,该机制可以用于肌强直性营养不良1型的治疗目的,”Nitschke说。

更多信息:Larissa Nitschke等,选择性剪接介导MBNL2在MBNL1功能丧失时的代偿性上调,核酸研究(2023)。DOI: 10.1093 / nar / gkac1219

期刊信息: 核酸研究

所提供的贝勒医学院
引用:如何补偿基因功能的丧失?想想2023年2月24日从//www.pyrotek-europe.com/news/2023-02-compensate-loss-gene-function-alternative.html检索的alternative splicing(2023, 2月21日)
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