表观遗传学的收敛和数学预测和拦截癌细胞的行为
![Epigenetic landscapes and phenotypic plasticity in cancer. Regulatory networks can define the number and probabilities of stable cellular states adopted by a cell population, representing attractors in the epigenetic landscape. Diverse inputs can promote transitions (and corresponding phenotypic plasticity) between cellular states within landscapes corresponding to the normal tissue (fewer attractors) and cancerous tumors (emergence of new attractors), as defined by parameters P1 and P2 that correspond to effective concentrations of landscape-defining molecules. Credit: Science (2023). DOI: 10.1126/science.aaw3835. https://www.science.org/doi/10.1126/science.aaw3835 表观遗传学的收敛和数学预测和拦截癌细胞的行为](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/the-convergence-of-epi.jpg)
现在广为人知,癌症是一种疾病获得缺陷的基因和基因的功能。2月9日发表的一篇文章科学由安德鲁·范伯格,医学博士约翰霍普金斯Kimmel癌症中心的基础生物医学科学研究所(ibb)和安德烈•Levchenko科学博士cari jo clark。,硕士耶鲁大学的工程和应用科学,地址新的定量方法更好的定义和衡量这些缺陷基因的功能,称为表观遗传学,和他们的相互作用与癌症的遗传景观。
表观遗传学及其打开和关闭基因的能力通过化学变化区域的基因和DNA内打包的方式细胞核是许多生物过程的一个关键特性,如胚胎发育。在癌症发展,范伯格说,表观遗传变化促进表型可塑性,肿瘤细胞持续改变行为,帮助癌症侵入周围组织,转移至其他器官和逃避自然defenses-such免疫化疗反应。在癌症,这预示着恶性肿瘤细胞的可塑性改变国家侵犯其他细胞和组织能力在整个身体和维持生存。
数学提供了强大的工具来连接表型可塑性在癌症表观遗传变化驱动它。特别是,熵的测量(信息)的不确定性现在可以应用于表观遗传学。随着肿瘤的发展,控制细胞行为的表观遗传信息侵蚀,我们可以确定位置在这发生的表观基因组和基因驱动增加熵,范伯格说。
“新方法在定量分析现在的癌症表观遗传景观提供工具来理解遗传学和其他司机之间的连接癌症的发展和增长和表观遗传调控网络,调解的关系格局,”范伯格补充道,布隆伯格著名医学教授约翰·霍普金斯大学医学院的粉刷工程学院和彭博公共卫生学院的。
新技术整合癌症生物学和数学可以区分癌细胞和正常细胞,并量化和测量细胞的表观遗传调制状态,以及它如何影响细胞的行为,本文报告。
“如果我们理解这些过程,我们可以识别化学变化只出现在癌细胞诊断癌症更好和更早和预测其行为,所以我们可以用更多的靶向治疗干预,”范伯格说,ibb表观遗传学中心的主任。“这些定量方法必须治疗的一部分。我们不能理解癌症。”
更多信息:安德鲁·p·范伯格et al,表观遗传学作为一个中介可塑性的癌症,科学(2023)。DOI: 10.1126 / science.aaw3835。www.science.org/doi/10.1126/science.aaw3835