2023年2月3日报告
基因表达的性别和年龄差异与生物钟有关
![Genome-wide rhythmicity analysis and TF regulation. (A) Number of rhythmic genes (q(BH) 0.5) with q-value smaller than a threshold (x-axis) plotted as a function of the threshold across 46 tissues. (B) Number of common rhythmic genes (q(BH) 0.5) between different gene seed sets. (C) Number of 12h-rhythmic genes (q(BH) 0.5) with peak-trough amplitude higher than a threshold (x-axis, log2) plotted as a function of the threshold across 46 tissues. (D) Transcription factor activities. Polar plot of mean phase and mean R 2 values for the top 100 targets of all transcription factors (ChIP-Atlas) across the body obtained via cSVD (Table S5). These factors are mostly one with pan-rhythmic activity, i.e., the target genes are rhythmic in multiple tissues. Note: “The APC antibody used in those experiments (Bethyl Laboratories #A300-981A) shows several bands, one of which at the expected CLOCK weight. As the reported CHIP-seq targets overlap with clock genes, the antibody probably crossreacts with CLOCK.” Credit: Science (2023). DOI: 10.1126/science.add0846 基因表达的性别和年龄差异与生物钟有关](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/gender-and-age-differe.jpg)
洛桑综合理工学院(Fédérale de Lausanne)的三位生物工程科学家发现,基因表达的年龄和性别差异与生物钟有关。他们在杂志上发表的论文科学, Lorenzo Talamanca, Cédric Gobet和Felix Naef分析了基因型-组织表达项目获得的数据。
先前的研究表明,节律性变化发生在基因表达由于生物钟的原因,尤其是在早上和晚上。但正如这项新研究的研究人员所指出的那样,关于性别或年龄导致的昼夜节律基因表达差异的研究并不多。
为了找出这种差异是否存在,三人分析了基因型-组织表达项目获得的数据。他们从数据库中筛选出914名捐赠者,并将他们的RNA数据档案作为算法的输入,为给定的组织样本分配昼夜节律阶段。这使他们能够注意到基因表达的物质的水平,比如蛋白质。不同的水平在昼夜周期的不同部分表现出不同的表达水平-对46个组织样本进行了测试。
在看的来源组织样本在美国,研究人员观察到了组织类型、男性和女性捐赠者之间的差异,以及年轻和年长捐赠者之间的差异。更具体地说,他们发现,与身体其他组织相比,与新陈代谢相关的基因表达更有节奏,而脑组织则没有那么有节奏。他们还发现,与男性相比,女性的节律性更强年轻人比老年人多。
研究人员指出,性别差异比预期的要高得多——女性节律基因的数量大约是男性的两倍。它随时间变化身体部位女性在肝脏和肾上腺的基因表达中表现出更多的节律性。他们还发现了与年龄相关的身体部位的差异,例如,老年人与冠状动脉和心血管系统相关的基因的节律性较低。他们还发现生物钟随着年龄的增长,睡眠时间从24小时缩短到12小时。
更多信息:Lorenzo Talamanca等人,人类24小时基因表达节律的性别二态和年龄依赖组织,科学(2023)。DOI: 10.1126 / science.add0846
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