研究人员分析了遗传和表观遗传调控因子,以了解COVID-19的严重差异
感染SARS-CoV-2会导致一些人患上严重疾病,而另一些人则不会生病或只出现轻微症状。但为什么会这样呢?不幸的是,我们并不确切知道。我们确实知道,过度活跃的先天免疫系统正在导致严重的COVID-19疾病,但尚不清楚这是如何调控的。
来自汉诺威医学院(MHH)的杨丽教授领导的团队在回答这个问题上又近了一步。他们研究了疾病的进程在多大程度上是由基因或表观遗传调控的。该团队包括来自MHH的科学家,他们和李教授一样,也在卓越抵抗集群中进行研究。
该团队能够确定COVID-19中先天性免疫系统故障的潜在调节因子。此外,它还能够确认某些已经知道的事情遗传风险因素在COVID-19的发展中发挥作用。研究结果已发表在该杂志上细胞基因组学.本文的第一作者是Valerie Koeken博士、张博文博士和张振华博士。研究小组在个体化感染医学中心(CiiM)进行了这项研究。
在这项研究中,研究小组使用单细胞多组学分析检测了COVID-19患者血液中的单个免疫细胞。这项技术可以用来同时评估细胞是如何被调节的,以及它们是如何运作的。为此目的,检查细胞的遗传物质,以确定基因组的某些部分是否“开启”(表观遗传学),以及基因是否被转录成核糖核酸分子。
研究小组使用了一种特定类型的白细胞(单核细胞),这种白细胞在严重的COVID-19疾病中被过度激活,从而能够确定染色质可及性的改变是如何调节的基因表达并转录因子控制这些功能失调的单核细胞。此外,他们还能够确定特定的遗传变异是如何导致更高的病毒载量和COVID-19住院风险增加的。这使他们能够确定导致易感性增加的因素之一严重的疾病在某些人身上。“总的来说,我们的研究强调了导致COVID-19的多种遗传和表观遗传调控因子,”李教授说。
更多信息:张博文等人,改变的等位基因特异性开放染色质景观揭示了COVID-19先天免疫的表观遗传和遗传调控因子,细胞基因组学(2022)。DOI: 10.1016 / j.xgen.2022.100232