患者的基因变异影响药物代谢的非洲血统,发现研究

调查人员已经确定了新的基因变异影响肝细胞的基因表达病人的非洲血统,发现提供了解药物代谢不同在不同的人群,根据一项发表在《西北医学研究美国人类遗传学杂志》上。

表达式定量轨迹(eQTL)研究使用一个人的基因组和转录组的数据,发现独特的遗传变异,调节基因表达。然而,这些研究中使用的数据库历史具有非洲血统的弱势个体。

全面,multiomic数据揭示的关键机制,调节个体的基因组和了解不同群体的人们对药物的反应不同,它可以改善治疗策略根据Minoli佩雷拉,药理学博士,副教授,PharmD和该研究的资深作者。

“我们没有任何历史上人口排除运行这些数据分析,所以我的实验室的一大动机是创建数据在非洲血统的人群,他们在multiomics表示,“·佩雷拉说,他也是一个成员的西北大学的罗伯特·h·劳瑞综合癌症研究中心。

在最近的研究中,研究人员对hepatocytes-the主要细胞类型的肝脏肝组织样本的非裔美国人患者6 FDA批准的药物:利福平(用于治疗肺结核),苯妥英(用于防止癫痫发作),卡马西平(用于治疗癫痫、神经疼痛或双相情感障碍)、地塞米松(用于治疗炎症)、苯巴比妥(用来治疗癫痫)和奥美拉唑(用于胃痛和胃溃疡的治疗)。

研究人员然后在原发性肝细胞基因型和RNA进行全基因组测序和没有药物治疗。他们也映射eQTLs或单核苷酸多态性(SNPs)影响基因表达,在肝细胞中。

从这个综合分析,他们发现不同的转录的变化细胞系在不同药物治疗和确定NRF2作为一个潜在的基因转录监管机构。

“NRF2已经确定为药物代谢的一个非常重要的转录因子,但这是一个更全面的方法看,”佩雷拉说。

研究人员还发现将近3000基因变异影响肝细胞如何应对外部的刺激,包括药物,研究人员称之为eQTLs药物反应,或reQTLs。值得注意的是,他们发现reQTLs摘要如CYP3A5基因。

大多数人的欧洲血统携带特定的CYP3A5基因变异导致无/低CYP3A5酶,而个人的非洲血统携带变异频率较低。据她说,这是一个问题,因为大多数参与者招募的临床试验是欧洲血统,这些试验的结果直接通知频率和多大的药物应规定所有的病人,不管他们的祖先。

“当你测试药物在一群人有限的多样性,然后说这是剂量,这是代谢的速度,这就是你经常剂量药物然后你给整个美国人口这种药物,我们不确定这些措施如何精准,这只是一种变体。其他变异可能影响的多少我们调控的这些重要的酶,”佩雷拉说。

佩雷拉说她的团队正在扩大他们的工作通过增加肝细胞的数量从美国黑人参与者他们学习和结合其他类型的组学技术,如表观遗传分析。

”几乎都是我们做的表观遗传筛查在欧洲人口,所以我们能找到重要的表观基因组的非裔美国人。同时,因为有更多的遗传变异在非洲血统的人,这会改变表观基因组的方式我们不能够看到在欧洲,”佩雷拉说。“我们希望我们所做的可以帮助非洲注释新的研究进展祖先人口。”