一项针对癌症的分析发现了减少肿瘤的全癌症靶点
![Cell line expression of tumor-specific TE-chimeric transcripts. a, Box plots with overlaid dot plots of the number of candidates expressed in each cancer cell line profiled across various tumor types. The ‘N=’ lists the number of cell lines in each boxplot. Box plot format: center line, median; box limits, upper and lower quartiles; whiskers, 1.5x interquartile range. b, Heatmap of CAGE-seq TPM expression of candidates across the 10 cancer cell lines we profiled. At the top is a dot plot showing how many TCGA tumor samples a candidate is present in. Credit: Nature Genetics (2023). DOI: 10.1038/s41588-023-01349-3 一项针对癌症的分析发现了减少肿瘤的全癌症靶点](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/a-cancer-wide-analysis.jpg)
华盛顿大学圣路易斯医学院的研究人员在转座元件(TEs)中发现了一种潜在的癌症免疫治疗新靶点,这是一种可以在基因组中移动的DNA短片段。
在论文“泛癌症分析鉴定肿瘤特异性抗原衍生自转座因子”发表在自然遗传学在美国,研究人员使用了癌症基因组图谱(TCGA),这是一个包含2万多个癌症样本的数据库,涵盖33种不同的癌症类型和675种癌细胞系.
本文的重点是转座的元素(TEs)存在于人类基因组但它们通常处于休眠状态。顾名思义,这些DNA片段可以插入到其他基因中。最典型的例子是一种逆转录病毒遗传密码在宿主的基因组中。基因组已经为这种入侵做好了准备,持续的复制和插入通常会被“关闭”。
当癌症发生时,它们没有太多正常的基因失效保护措施,因为它们通常起源于DNA受损的细胞。在复制过程中,癌症允许这些休眠的TEs重新获得它们内部的转座能力癌症细胞而且,根据这项研究,“驱动非典型转录本的表达,有时,这些转录本可以在肿瘤样本中高度表达和广泛共享。”
正因为如此,研究人员能够在98%的不同类型的肿瘤中发现TEs,并发现“这些转录本有可能产生良性组织中不存在的新肽”,这表明了一种针对肿瘤的新方法,适用于各种癌症类型。
该研究确定了1068种肿瘤特异性TE候选基因,它们有可能产生共享的肿瘤特异性TE嵌合抗原(TS-TEAs)。目前有针对特定抗原类型的癌症治疗方法,需要更多的研究来证实这一途径可以利用这些ts - tea攻击肿瘤细胞。
医学科学总是在小的、迭代的发现步骤中运行,导致了充满警告的潜在治疗方法。这里的不同之处在于,通往治愈的许多途径已经被探索过了。
目前的研究揭示了肿瘤内部的一种机制,它为现有的治疗方法创造了可能的靶点。这一发现可能会导致新的治疗方法癌症治疗有强烈的迹象表明,通过进一步的研究,一种单一的治疗类型可以治疗全身的多种癌症类型。
更多信息:Nakul M. Shah等人,泛癌分析鉴定源自转座元件的肿瘤特异性抗原,自然遗传学(2023)。DOI: 10.1038 / s41588 - 023 - 01349 - 3
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