确定HIV睡在大脑
![Microglia HIV-1 ISs map to introns of highly transcribed genes recurrently targeted in T cells(A) Normalized chromosomal distribution of the integration events for CD4 + T cells, MDMs, and microglia. Integration density is calculated for each cell type as the number of integrations per chromosome per total number of integrations divided by chromosome length.(B) Bar plot showing the percentage of ISs falling into promoters (microglia, 20.1%; MDMs, 25.7%; CD4 + T cells, 20.2%; from the transcription start site [TSS] to 2 kb upstream), 3′ UTRs (microglia, 2%; MDMs, 2.4%; CD4 + T cells, 2.3%), 5′ UTRs (microglia, 0.1%; MDMs, 0.1%; CD4 + T cells, 0.14%), exons (microglia, 1.9%; MDMs, 2.5%; CD4 + T cells, 1.6%), introns (microglia, 60.2%; MDMs, 56.3%; CD4 + T cells, 57.2%), downstream (microglia, 0.9%; MDMs, 1.1%; CD4 + T cells, 0.9%; from the transcription end site [TES] to 3 kb downstream), and distal intergenic regions (microglia, 14.5%; MDMs, 11.7%; CD4 + T cells, 17.3%).(C) Shared integrations in CD4 + T cells, MDMs, and microglia. Shown is a comparison of the genes between CD4 + T cells (n = 5,199), MDMs (n = 750), and microglia (n = 2,719) with at least one integration in their gene bodies.(D) Bar plot representing the percentage of genic ISs according to their expression levels determined by RNA-seq into high, mid, low, or no expressed genes in microglia and CD4 + T cells compared with the global gene expression levels in each cell type. Credit: Cell Reports (2023). DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112110 艾滋病毒大脑睡在哪里](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/where-hiv-sleeps-in-th-1.jpg)
人类免疫缺陷病毒hiv - 1能够感染人类的各种组织。一旦进入细胞,病毒其基因组整合到细胞的基因组,并建立持久的感染。结构的作用和组织hiv - 1感染宿主基因组的原因还不是很清楚。
使用一个基于大脑免疫小神经胶质细胞,细胞培养模型海德堡大学的科学家领导的一个国际研究小组医院感染研究中心和德国(DZIF)现在的hiv - 1定义插入模式基因组小神经胶质细胞。
一个感染人类免疫缺陷病毒(HIV)是在99年,9%的病例还是不治之症。这是因为病毒保持休眠状态很长一段时间在感染细胞的基因组,这无形的和难以接近免疫系统和抗病毒药物。hiv - 1的途径需要潜伏在宿主细胞基因组研究主要是血液中CD4 + T细胞病毒的主要靶细胞。
然而,hiv - 1感染其他免疫细胞在不同器官的能力,建立稳定的水库。这样一个病毒避难所是大脑,病毒感染主要是小神经胶质细胞的免疫细胞,常常导致神经炎症和hiv - 1相关的神经认知障碍的症状(手)。
hiv - 1感染、复制等问题在大脑中已经很难解决,因为研究是有限的病人在他们的大脑中监测病毒的能力。由滨Lusic博士领导的一个国际研究小组从海德堡大学医院和DZIF现在成功地开发HIV-1-infection人类小神经胶质细胞培养模型。
建立的模型允许第一次调查hiv - 1基因的插入小神经胶质细胞。基因插入导致病毒基因组的压制,导致所谓的“睡眠病毒”表型。
研究人员最近公布了他们的发现细胞的报道,利用小神经胶质细胞模型来确定hiv - 1整合网站,并将它们与染色质的结构和监管元素。
大脑的“HIV-1-infections建模免疫细胞使用小神经胶质细胞培养时,我们发现了一个更强的细胞染色质之间的相关性因素和病毒表型睡觉,”论文的第一作者莫娜Rheinberger说。
“这种蛋白质,叫做CTCF是最重要的建筑之一,蛋白质的细胞基因组,参与染色质折叠和包装内的细胞。我们的发现表明CTCF是塑造的hiv - 1基因插入配置文件小神经胶质细胞,从而导致了潜伏性感染状态。”
“这些研究在细胞培养模型是非常重要的了解这种病毒可以有针对性的在身体的不同部位,它会潜伏或造成神经紊乱甚至在目前的治疗方案,“Lusic博士总结道。
更多信息:莫娜Rheinberger et al,基因组分析小神经胶质细胞中hiv - 1整合链接病毒集成领域相关的拓扑,细胞的报道(2023)。DOI: 10.1016 / j.celrep.2023.112110