在基因组的3 d视图可以帮助治疗儿童脑癌

助理教授领导的研究人员桑福德Burnham Prebys卢卡斯查韦斯,博士,利用最新的技术,看一个以前从未见过的室管膜瘤,一种最致命的小儿脑瘤。通过可视化基因是肿瘤细胞内的组织和安排,他们能够揭示基因在肿瘤可能是未来治疗靶点。结果出现在自然通讯。

“人类基因组是由很多吗蛋白编码基因和一个更大数量的非编码部分,都紧紧地包装,卷装进小核的细胞,”查韦斯说。“我们使用先进的技术来看看基因组包装盘,给了我们一个独特的视角在基因调控的机制。这种方法可以帮助我们了解基因组的形状和之间的联系癌症。"

脑部肿瘤脊髓,包括瘤是最常见的恶性肿瘤在14岁以下儿童死亡的主要原因,疾病在儿童时期在美国。

“瘤进来许多不同的基因和分子亚型可以影响病人对治疗有多好,”查韦斯说。“目前的标准治疗治疗包括手术之后,辐射,具有长期的风险,治疗导致神经副作用以及二次癌症。室管膜瘤新的靶向治疗的选择是迫切需要的。如果成功,我们的研究将导致新的,有效的药物治疗这些危险的癌症。”

研究人员关注最常见的和激进的形式的疾病,主要发生在儿童。他们使用一个新兴技术3 d基因组映射,以可视化的细胞核内基因是如何组织的细胞。

“科学历来研究基因组在二维空间中,专注于基因是如何安排的,线性序列,”查韦斯说。“但基因组是一个3 d对象和其他事情一样,和基因排列在空间让这些基因表达的差异。”

研究人员研究了先前未被发现的循环室管膜瘤肿瘤的基因组。这些循环改变基因表达的方式,进而产生信号帮助肿瘤生长。

“我们已经证实,这些基因的配置循环室管膜瘤肿瘤至关重要,”查韦斯说。“这意味着我们现在有一个新的候选人的治疗目标,我们就不会能够识别没有这项技术。”

研究人员认为,他们的研究结果将为进一步的研究奠定基础,将导致未来的疗法。研究人员还计划看看其他小儿癌症,因为许多此类疾病有一些治疗选择。

“有惊人数量的肿瘤,我们难以治疗,因为我们根本不知道它们是如何工作的从生物的角度来看,”查韦斯说。“这项工作表明,还有很多我们仍然不知道肿瘤的基因组,并解开这些谜团的关键可能是最后克服这些激进的癌症。”