非洲科学家如何工作池数据解码疾病

传染病疫情在非洲国家,不幸的是,太常见了。刚果民主共和国的埃博拉病毒或乌干达;马尔堡病毒在几内亚或赤道几内亚;在马拉维霍乱;疟疾和肺结核。

这些疾病不尊重人造或边界。这是至关重要的,科学家在非洲能够生成和共享关键数据时间告知公共卫生决策的病原体。

基因组测序技术是强大的工具在这种工作。他们使科学家能够解码疾病的遗传物质,创造生物“指纹”调查和跟踪这些疾病的病原体。这些信息有助于发展诊断,治疗和疫苗。它还帮助公共卫生当局指导和准备他们的公共卫生系统有效的疫情检测和反应。

应对传染病的国家和大洲需要许多复杂、重叠和广泛的干预措施。其中之一是一个国家的公共存储库,公共卫生当局和科学家可以共享信息和病原体引起的疾病。他们可以合作共享数据。这些类型的平台存在在许多高收入国家。但非洲地区落后。

这将改变。在一个新的出版自然医学我们大纲所做的工作为非洲大陆创建这样一个库。

人类和经济成本

非洲占大部分的大约1000万人死亡全球每年由传染病引起的。

这些疾病还踩刹车在非洲大陆的发展雄心:世界卫生组织(世卫组织)的一份报告称他们为一个账户每年估计生产力损失8000亿美元。

这些数据突出科学应对改善的紧迫性传染病。

有一些绿芽。COVID流行显示什么非洲机构有能力。非洲的非洲疾病控制中心(CDC),通过非洲病原体基因组计划,负责培训数以百计的实验室工作人员。

DNA测序机器和必要的实验室consumables-like试剂,使测试的化学混合物有可能到位。今天,在许多非洲国家公共卫生实验室,与不同层次的能力,可以生成自己的病原体的基因组序列。

因此,数据没有问题。的问题是:会发生什么,?如何以及在哪里了,和谁?会,一直自定义到目前为止,“导出”和知识产权转移到海外吗?

全球数据共享平台中扮演了重要角色的共享数据。然而,透明度和治理问题目前正在提出的全球社区。

自2020年以来,非洲的疾病预防控制中心合作非洲实验室医学学会,南非国家生物信息学研究所和几个非洲公共卫生机构正在努力开发一个大陆病原体基因组数据管理和共享的平台。涉及到的技术创新和发展行业和其他合作伙伴。

这样一个平台的发展不仅仅是一个技术练习,虽然。必须创建一个生态系统的采用。所以它被建在平行与非洲疾控中心领导的协商其成员国,完善国家和支持国家之间数据共享协议数据治理框架。

该平台基于六大支柱。

协作和一致性

第一个支柱是采用和变更管理。区域organizations-those培训和开车基础设施投资在COVID-19大流行的工作必须把发展必要的政策、流程和系统改变整个非洲大陆。

其次,平台必须提供一个良好的用户体验,将允许无缝的,具有成本效益的数据收集和数据的及时共享和使用整个非洲。

第三,我们需要数据服务和产品来促进共享数据和信息与决策者不是科学家或遗传学家。

第四,标准化和一致的数据管理流程、实践、工具和控制对数据处理,存储、共享和部署需要各国和上下文。

核心基础设施是第五个支柱:平台的技术方面必须由应用程序和基础设施组件,这些组件可以快速重新配置环境和疾病。

最后,良好的项目管理和可持续的资源将是关键。

一个迫切需要解决的全球性问题

我们认为在我们的杂志文章、数据管理和分析支持数据驱动的决策在公共卫生是一个迫切需要解决的全球性问题。它需要持续参与国际疾病监测利益相关者和技术平台开发人员。

无节制的疾病在非洲的人力和资源成本已经指出。如果会有一个集体应对非洲的负担,现在它是一个巨大的任务共享病原体基因组数据平台支撑这些努力将是一个至关重要的一步。

一个非洲和非洲拥有了数据共享平台将及时分享本地生产的关键数据通知快速应对疫情。它也将成为一个关键一步一个公平的机制的价值和效用最大化病原体基因数据为国家、区域和全球卫生安全。

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