计算分析表明,在印度登革热病毒进化
多机构研究研究登革热由印度科学研究所的研究人员(印度)显示了病毒导致疾病发生了翻天覆地的变化,在过去的几十年里在印度次大陆。
例登革热成为一个蚊媒病毒性疾病——稳步增加在过去的50年中,主要集中在东南亚地区。然而,在印度没有批准登革热疫苗,尽管一些疫苗已经在其他国家发达。
“我们正试图了解不同的印度变异,我们发现他们非常不同于原始菌株用于开发疫苗,”拉胡尔罗伊说,化学工程系副教授(CE),印度,不过该研究的通讯作者发表在PLOS病原体。他和合作者检查所有可用的(408)印度登革热病毒感染患者的基因序列被别人收集的1956年和2018年之间以及团队本身。
有四个广泛categories-serotypes-of登革热病毒(登革1、2、3和4)。使用计算分析,这个研究团队还检查了每一种血清型偏离他们的祖先序列,从对方,和全球其他序列。“我们发现,序列改变以非常复杂的方式,”罗伊说。
直到2012年,印度的主要菌株是登革1和3。但近年来,全国登革2越来越占主导地位,而登革热上岸就被认为是最infectious-is现在做一个利基为自己在南印度,研究人员发现。团队试图探讨什么因素决定哪些应变占主导地位的是一个在任何给定的时间。一个可能的因素是抗体依赖性增强(正面)说,苏拉Jagtap,博士生在CE和这项研究的第一作者。
Jagtap解释说,有时,人可能感染首先与一个血清型,然后建立一个二次感染不同的血清型,导致更严重的症状。科学家相信,如果第二个血清型类似于第一个,抗体在首次感染后宿主的血液生成绑定到新的血清型和绑定到巨噬细胞的免疫细胞。这个距离让新来的感染巨噬细胞,使感染更严重。“我们知道正面提高程度,(但)我们想知道如果这也可以改变的进化登革热病毒,”Jagtap补充道。
在任何给定的时间,几株每个人口中存在病毒血清型。抗体的生成人体原发感染后提供完整的保护各血清型2 - 3年。随着时间的推移,抗体水平开始下降,和交叉-血清型失去保护。研究人员提出,如果身体感染这个时候similar-not identical-viral菌株,然后正面,给这个新菌株,一个巨大的优势使其成为人口的主要菌株。
这种优势持续几年,之后成为抗体水平过低的区别。“这就是新纸,”罗伊说。“没有人显示之间的这种相互依存关系登革病毒和人类的免疫力。”This is probably why the recent Dengue 4 strains, which supplanted the Dengue 1 and 3 strains, were more similar to the latter than their own ancestral Dengue 4 strains, the researchers believe.
这样的见解,才有可能从研究疾病与基因监视印度这样的国家,罗伊解释说,因为这里的感染率已处于历史高位,和一个巨大的人口进行抗体从先前的感染。
更多信息:苏拉Jagtap et al,登革热病毒的进化动力学在印度,PLOS病原体(2023)。DOI: 10.1371 / journal.ppat.1010862