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新孟加拉国霍乱substrains发现基因监测证实疫苗接种的重要性

新孟加拉国霍乱substrains发现基因监测证实疫苗接种的重要性
系统发育和霍乱弧菌的时空分布,7宠物演化支3和5。一个子树的整个基因组SNP最大似然outgroup-rooted 223种系发生树霍乱弧菌菌株从库克斯巴扎是这项研究,872年发表的基因组演化支3和5(见补充满7宠物树图S2)。树的建议是由分组人口彩色(见键)。彩色条表示hierBAPS进化枝(1级集群)和subclade(二级聚类),以前sublineages出版和地理亚区。介绍事件/ sublineages用彩色的分支(见键)。b孟加拉湾Subclade分布在城市(孟加拉国和印度)。地图是通过从雄蕊StamenMaps设计(www.maps.stamen.com/toner)获得的,基于知识共享归属(3.0)CC许可(https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/)并使用R包ggmap绘制。c时间分布的进化枝3和5 subclades。基因组计数用的大小,而形状表示ctxB类型(见键)。点以上情节线图显示进化枝的数量3和5 subclades每年。信贷:自然通讯(2023)。DOI: 10.1038 / s41467 - 023 - 39415 - 3

研究人员已经发现了两个新的霍乱substrains在流离失所的难民人口在孟加拉国南部,一个先发制人的大规模疫苗接种运动超过一百万难民是成功预防流行病。他们还表明,霍乱细菌发起这个活动是高风险流行毒株导致全球霍乱暴发。

在一项新的研究中,发表在自然通讯威康桑格研究所领导的研究小组,国际腹泻病研究中心,孟加拉国(位于),使用全基因组测序分析和跟踪霍乱菌株在孟加拉国南部放逐罗辛亚族人的难民人口。

通过分析223年霍乱样本,收集2017年至2019年,研究人员发现,主应变循环7一个已经造成数百万人死亡在全球大流行,自1960年代以来一直在持续的。

工作也发现了两个新的霍乱sublineages强毒株,7个宠物,一个全球存在,另一个在亚洲和中东地区。这两个霍乱sublineages也影响人们以不同的方式,不同的清除事件的数量或类型的凳子上,例如。研究细菌的遗传代码的变化,这就可以解释为什么每个应变呈现出不同的疾病模式。这也证明了难民的大规模疫苗接种运动网站是至关重要的,合理的。

能够分配造成重大疾病爆发的风险对于每个独特的血统确保公共卫生官员可以准备流行,尤其是对弱势群体如难民营。

据估计,每年有400万到1.3例霍乱,21000到14000人死亡,由于这种疾病。如果不及时治疗,它迅速致命的。获得安全饮用水和卫生设施是至关重要的预防和控制霍乱的传播,这意味着不太富裕的社区更容易受到这种疾病。

在孟加拉国,霍乱流行,估计有6600万人处于危险之中。区分细菌的血统,霍乱弧菌,导致霍乱可以准确而难以或者不可能

博士后研究员博士Alyce Taylor-Brown威康基金会桑格研究所的这项研究的第一作者,说:“重要的是我们将演示如何使用基因组学来追踪的霍乱菌株在世界各地的传播。这是我们第一次有这种类型的证据,关键在于,帮助公共卫生当局做出正确的决策,以确保健康弱势群体。”

“在孟加拉国,2017年的疫苗接种干预是几十年来最大的霍乱疫苗接种运动,什么是我们的研究显示,没有疫苗的介入,传染病的风险库克斯巴扎是非常高的。”

研究表明,基因组霍乱监测在大规模预防接种运动可以帮助政府官员做出明智的决定。在这种情况下,基因组数据给重要的信息流通中的特定菌株在社区内证实,疫苗接种活动目标细菌的毒性更强。这些活动一直持续到2021年12月,自2014年以来有七个活动更成功。

博士菲尔多西卡,高级主管,传染病部门位于b,和该研究的资深作者,说:“这项研究很重要,因为它表明不仅是大规模疫苗接种关键在孟加拉国阻止疫情在很短的时间内,而且基因组和流行病学监测是一个必要的工具帮助疫苗策略当疫苗短缺是目前的情况。对于未来,我们留下了一个很好的机会。”

“我们的工作表明,霍乱菌株孤立的难民人口密切相关菌株被发现在达卡,暗示有局部传播内部和难民营和主机之间的人口在孟加拉国。通过了解这进一步我们将能够得到一个明确的证据表明疾病传播是在孟加拉国和什么可以采取进一步行动来阻止它。”

教授尼克•汤姆森寄生虫和微生物项目负责人威康基金会桑格研究所的这项研究的资深作者说,“疫苗接种活动是非常成功的,一旦发生人道主义危机发起的。像所有干预措施,是不可能知道会发生什么,如果没有采取任何措施。但显而易见的是,这株霍乱弧菌在座造成大规模疫情在世界其他地方导致许多生命的损失。”

“考虑到基因证据,没有理由怀疑政府的迅速干预的孟加拉国和位于b防止在这里起到了至关重要的作用。重要的是,没有疫情清算日期。”

更多信息:Alyce Taylor-Brown et al,基因流行病学的霍乱弧菌在流离失所的大规模疫苗接种运动社区在孟加拉,自然通讯(2023)。DOI: 10.1038 / s41467 - 023 - 39415 - 3

期刊信息: 自然通讯

引用孟加拉国霍乱substrains:新发现的基因监测证实疫苗接种的重要性(2023年7月18日)检索2023年7月20日从//www.pyrotek-europe.com/news/2023-07-cholera-substrains-bangladesh-uncovered-genomic.html
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