合作开发新的化合物对SARS-CoV-2变异与承诺活动
马尔克斯集团EMBL的格勒诺布尔之间的协作和意大利欧洲生物医学研究所的研究人员萨勒诺(EBRIS)导致了小说的发展和特性的小分子抑制剂,对三SARS-CoV-2变异显示承诺活动。bob88体育平台登录
在欧洲药物化学杂志》上,科学家们描述一代化合物,将采取行动反对SARS-CoV-2的主要蛋白酶。这些化合物之一,是目前临床候选人对SARS-CoV-2鼻内喷雾的发展。此外,由于高度保守的氨基酸序列的目标酶的活性部位在冠状病毒,这种抑制剂可以从不同的冠状病毒物种治疗感染。
意大利研究小组,由西蒙·迪Micco在2020年初开始研究SARS-CoV-2。已经对新的生物活性分子的设计感兴趣,他们迅速调整了其先前的研究乳糜泻对这个新的方向。Di Micco的团队可以使用在硅片的方法来设计新化合物针对病毒的关键酶之一,他们没有办法算出真实的结合分子之间的相互作用及其生物的目标。
结构生物学是一个重要的学科分子生物学用于药物开发。通过获得与生物分子相互作用的原子结构目标,结构生物学家可以提供重要的见解对其模式绑定和使用此信息来设计新的分子改进的亲和力和特异性。
完全自动化的x射线晶体学管道由EMBL的共同开发和运营的格勒诺布尔和ESRF尤为适合,因为他们允许快速筛选的化合物库,可以用来识别结合的小分子生物的目标。
然而,Di Micco集团没有事先在结构生物学方面的专业知识,也没有设备来执行实验。在这一点上,Di Micco Instruct-ERIC主持的参加了一个研讨会,结构生物学研究的基础设施,支持欧洲研究人员通过向他们提供高端技术和方法。
除了提供高质量的科学,EMBL的结构生物学服务支持外部研究社区在欧洲通过提供一系列的方法和基础设施通常基于EMBL的独特的技术。
高通量结晶实验室(HTX实验室),由马尔克斯团队运营,是最重要的设施之一,高通量nano体积和结晶筛选在欧洲。
这些管道使用自动水晶收获和cryocooling CrystalDirect技术。他们把这种方法与使用EMBL的晶体信息管理系统(罪犯),一个基于web的软件套件提供网络接口设计和评价结晶实验,实时访问结果和实验参数。
有了这个系统,世界各地的科学家们可以在他们的样品邮件并按照每一步结晶的x射线衍射实验和结构解决方案,远程获取所需的信息。“这是什么使HTX实验室不同于其他实验室进行晶体学,“说Rahila Rahimova,马尔克斯的博士后团队。
Rahimova,一起研究技术员Lea Mammri和何塞马尔克斯是支持Di Micco专长结构生物学和生物物理方法,进行x射线晶体学研究描述新化合物和SARS-CoV-2之间的分子间相互作用的主要蛋白酶。
这个跨学科合作很快取得成果。结构研究执行EMBL的格勒诺布尔透露如何化合物结合,抑制SARS-CoV-2主要蛋白酶,对病毒生命周期至关重要。此外,这种提供重要反馈Di Micco组织可以使用它来进一步完善药物设计过程。这导致一种化合物与细胞毒性很低,减少副作用的风险。
“我想在科学强调合作的重要性。在我们的案例中,它也可以获得访问EMBL的格勒诺布尔的设施,服务,设备,和专业知识由于伊西多尔,”Di Micco说。传染病疫情研究综合服务(伊西多尔)提供了科学家在研究人类传染病访问欧洲的设施,服务,设备,和专业知识。
本研究也关系到感染生物横向主题,EMBL 2022 - 26日计划的一部分“分子生态系统。”This theme aims to contribute to research on infectious diseases and the biology of their mechanisms, diagnostics, and treatment.
Di Micco下一步是测试这个分子在临床试验中,由于这种化合物铺平了道路走向对COVID-19新疗法的发展。“感染浓度最高的鼻子开始:之前上呼吸道和肺部。鼻内喷雾将简化管理的药物没有援助的护士或医生,或需要去医院,”他说。
更多信息:西蒙Di Micco等,设计合理的zonulin抑制剂AT1001衍生品作为潜在的抗SARS-CoV-2,欧洲药物化学杂志》上(2022)。DOI: 10.1016 / j.ejmech.2022.114857