HuBMAP创建下一代分子分析技术和工具,使组织的3 d地图

往往对人类生物学的研究进行当身体被迫从感染或疾病。现在,作为一个更大的努力描绘“健康”是什么样子,两个斯坦福大学医学团队展开详细的分子地图健康人体肠道和胎盘组织。

地图,从而捕获细胞,细胞数量和其他细胞的细微差别,只是两个映射的集合,将建立一个细胞的大部分的底线人体,包括细胞在某些组织聚集的地方,如何组织发展在怀孕期间和细胞间的相互作用推动人类生物学。

的研究,将发布自然7月19日,正在努力牵头的一部分人类生物分子图谱计划被称为HuBMAP。它旨在填补知识的空白时人体如何工作在最佳状态。许多团队从美国和欧洲为HuBMAP财团。

“在研究中,我们有一个学习的好习惯不正常的事情没有真正理解正常是什么样子,”迈克尔·安吉洛说,医学博士,博士,助理教授的病理学也HuBMAP指导委员会的联合主席。“这是创建了一个巨大的差距在我们的知识。HuBMAP是唯一的工作,系统地关注这些组织的空间架构。”

通过结合细胞成像技术,机器学习和其他的分子分析方法,研究人员的团队创建一个全面的资源更好地理解人体组织。在项目过程中,收集的数据包括成像数据和注释,将通过HuBMAP公开。目的是使研究人员研究组织特点,理解疾病机制,开发自动注释工具,识别和描述细胞。

在导致映射人体总的来说,迈克尔•斯奈德博士,斯坦福大学教授w . Ascherman遗传学和HuBMAP指导委员会前主席和他的团队专注于小肠,揭示这类组织的主要特性:

肠细胞聚集在“社区”,这是由不同数量的特定功能的细胞类型。这些社区人员能够映射到单个细胞的水平。

新的地图显示,有趣的临床关系:研究人员发现,身体质量指数有较高的组织捐助者M1巨噬细胞数量大大增加,一种免疫细胞与炎症有关。和捐助者有高血压病史的有更少的不同类型的免疫细胞,叫做CD8 T细胞,它扮演一个角色在寻找和摧毁癌细胞。

安吉洛的团队集中在母胎组织改造过程中,从胎儿细胞嵌入到子宫壁。他们的研究详细的几个关键部分发育生物学在怀孕期间:

团队绘制了复杂的、高度协调细胞滋养层之间的交互,支持细胞在胚胎发育早期,母亲的免疫系统,适应这些陌生的细胞如胎盘形式。

螺旋状动脉,嵌入在胎盘和输送血液和营养从母亲到婴儿改变他们的细胞组成,以确保细胞从婴儿的母亲是纳入胎盘。这项研究是第一个按顺序显示这些动脉改变un-remodeled完全重建。

斯奈德和Angleo希望建立详细的基线,配合其他几十个研究团队创建细胞在HuBMAP地图,将帮助科学家进一步了解会发生什么健康的身体生病。

“这是真正的第一个人体高度详细的空间地图,让我们不仅看到有什么细胞,但他们是如何组织的,”斯奈德说。“很难理解疾病如果你不知道的健康状态是什么样子的。这些地图将使我们开始比较在不同的器官和分析疾病期间出错。”