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小儿肝母细胞癌模型暗示DNA损伤修复途径的新疗法gydF4y2Ba

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癌症基因和致癌途径依赖肝胚细胞瘤细胞。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba图显示依赖性癌症基因的全基因组CRISPR屏幕的程序使用ABC-Myc NEJF10细胞系。gydF4y2BabgydF4y2Ba,gydF4y2BacgydF4y2Ba癌症的重要基因和肿瘤抑制中标识与罗斯福截止< 0.25 NEJF10细胞系。轴表示总基因数。Y轴表示log10 p值。gydF4y2BaPgydF4y2Ba获得的价值排列测试和罗斯福的计算经验排列gydF4y2BapgydF4y2Ba值使用MAGeCK Benjamini-Hochberg过程。gydF4y2BadgydF4y2Ba癌症通路富集分析依赖基因识别ABC-Myc细胞系利用GSEA和本金保证产品(化学和遗传扰动)的数据集。gydF4y2BaegydF4y2Ba规范癌症通路富集基因被CRISPR屏幕NEJF10细胞系。gydF4y2BafgydF4y2Ba河马在基因识别信号通路丰富CRISPR屏幕NEJF10细胞系。gydF4y2BaggydF4y2Ba维恩分析基本基因(负选择)和肿瘤抑制基因(积极的选择)确定从NEJF1 NEJF6 NEJF10。CRISPR罗斯福截止< 0.25。gydF4y2BahgydF4y2Ba癌症依赖基因识别在人类肝母细胞癌Huh6细胞系DepMap数据(www.depmap.org)。gydF4y2Ba我gydF4y2Ba河马在基因识别信号通路丰富CRISPR屏幕Huh6细胞系。gydF4y2BajgydF4y2Ba血红素生物合成途径在积极的选择丰富NEJF1细胞。源数据作为源数据文件提供。信贷:gydF4y2Ba自然通讯gydF4y2Ba(2023)。DOI: 10.1038 / s41467 - 023 - 39717 - 6gydF4y2Ba

圣裘德儿童研究医院的科学家创造了一个肝母细胞癌(肝癌)模型,更准确地反映疾病的病理学和基因组学。研究使用模型指向潜在途径改善疗法,包括DNA损伤修复途径是著名的为他们的参与其他类型的癌症。gydF4y2Ba

肝母细胞癌是一种gydF4y2Ba最常影响三岁以下儿童。这种癌症了全世界最大的所有小儿癌症发病率增加。为gydF4y2Ba占20%的情况下,一个风平浪静的生存的机会少于50%凸显出巨大的新疗法的必要性。gydF4y2Ba

“这些患者通常接受化疗的高危疾病,尤其是在谈到在儿童肝母细胞癌仍在发展gydF4y2Ba可以是一个大问题,”杨说通讯作者君博士圣裘德外科学系。gydF4y2Ba

改善的关键一步gydF4y2Ba是确保一个健壮的、方便的模型研究存在。这种模式通常是一组实验室培养的细胞称为细胞株复制再生癌症和特点可以很容易地和运输,可以让世界各地的研究人员研究癌症发展和如何回应疗法。gydF4y2Ba

能够进行有意义的癌症研究直接相关的可用性这些细胞系;这已经严重缺乏某些癌症。圣Jude-led团队转向下一代测序技术来洞察肝母细胞癌基因组学的创建一个更精确的模型。gydF4y2Ba

下一代技术描述肿瘤gydF4y2Ba

认识到改进的细胞系可能导致突破,改善病人的治疗,研究人员开始寻找gydF4y2Ba驱动肝母细胞癌。MYC家族的蛋白质,在转录功能,在大多数人类癌症特异表达,包括肝母细胞癌。研究人员MYC基因突变的gydF4y2Ba和发现它快速而可靠的肝母细胞癌的形成。完整的描述是现在需要验证他们的工作。gydF4y2Ba

肝母细胞癌是已知的转录水平异质性高,意味着细胞肿瘤中的表达基因在不同的水平,在不同的时间。这可能表明他们对治疗的反应是不同的。单细胞核糖核酸测序技术的可用性和空间转录组允许研究人员描述模型肿瘤彻底并确保其符合patient-derived肿瘤。gydF4y2Ba

“这些技术允许我们查看正常组织和肿瘤细胞的当地环境,提供高分辨率的窥视的肿瘤转录异质性以及肿瘤内不同的“社区”,“共同通讯作者湘Chen说博士,圣裘德计算生物学。“我们的模型概括高度的肿瘤异质性模仿的异构性问题观察病人肿瘤,”他解释道。gydF4y2Ba

为肝母细胞癌DNA损伤修复途径提供了新的治疗途径gydF4y2Ba

细胞系的建立,研究人员探索新的治疗肝母细胞癌治疗的样子。他们进行了全基因组CRISPR-Cas9屏幕识别重要基因肿瘤细胞生存所必需的。超过1500个基因被确定为潜在的目标,100有预先存在的抑制剂。杨描述这是一个巨大的政变的字段:gydF4y2Ba

“这意味着我们可以找到许多目标的测试。任何研究人员通过共同的兴趣都可以使用我们的详细的筛选信息来验证假设和开发新的疗法,”他说。gydF4y2Ba

以及确定新的目标,研究人员希望看到哪些基因是影响传统化疗用于治疗肝母细胞癌,主要是阿霉素。阿霉素块酶负责肿瘤细胞生长和分裂,并通过观察肝胚细胞瘤细胞的遗传反应时管理患者,研究人员希望确定如何增加它gydF4y2Ba并提供更安全、更有效的治疗方法。蛋白质PRKDC被确认为这样一个目标,与阿霉素结合使用时,PRKDC抑制增强治疗效果。gydF4y2Ba

PRKDC是一种蛋白质与DNA损伤修复有关。研究人员提出的假设是,通过抑制PRKDC功能,DNA损伤是在恶化gydF4y2Ba和协同效应发生在阿霉素的作用是放大,从而杀死肿瘤。gydF4y2Ba

这项工作提供了急需的洞察一个常常被忽视的癌症病人将显著改善未来的前景。gydF4y2Ba

这项研究发表在《华尔街日报》gydF4y2Ba自然通讯gydF4y2Ba。gydF4y2Ba

更多信息:gydF4y2Ba杰方et al,癌症全基因组映射依赖基因和基因修饰符在高危肝母细胞癌的化疗,gydF4y2Ba自然通讯gydF4y2Ba(2023)。gydF4y2BaDOI: 10.1038 / s41467 - 023 - 39717 - 6gydF4y2Ba

期刊信息:gydF4y2Ba 自然通讯gydF4y2Ba

引用gydF4y2Ba:小儿肝母细胞癌模型暗示了小说的DNA损伤修复途径治疗(2023年7月7日)检索2023年7月8日从//www.pyrotek-europe.com/news/2023-07-pediatric-hepatoblastoma-hints-dna-pathway.htmlgydF4y2Ba
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